使用Multiwfn便利地查看所有激发态中的主要轨道跃迁贡献

使用Multiwfn便利地查看所有激发态中的主要轨道跃迁贡献 文/Sobereva@北京科音 First release: 2020-Jan-28  Last update: 2020-Jul-7 之前笔者写过一篇文章《电子激发任务中轨道跃迁贡献的计算》(http://sobereva.com/230),介绍了如何对TDDFT及类似方法计算的激发态计算轨道跃迁的贡献。在很多电子激发的研究文章中都会给出各个激发态中各种主要MO跃...

2019年下半年观看的非TV版动画简评

2019年下半年观看的非TV版动画简评 文/Sobereva  2020-Jan-20 这里对从2019年7月1日开始截止到2019年12月31日观看的非TV版动画进行简单评论。还有些此类动画看完后忘写了,就也不再补了。由于这类动画不好对比和打分,我也就不给出评分了。以往的此系列文章和TV版动画评论见http://sobereva.com右方的“动画评论”分类。 关于我转生变成史莱姆这档事 OAD01 长度:23m16s 讲述...

2019年下半年优秀动画音乐推荐

2019年下半年优秀动画音乐推荐 文/Sobereva  2020-Jan-19 这是第11次写“优秀动画音乐推荐”系列文章,此系列从2014年起不断发布,致力于尽自己微薄之力,令最杰出、最美妙的音乐能有出头之地,而不被数目是它们20倍以上的海量的平庸、凑数的音乐埋没。之前的动画音乐推荐见 《2019年上半年优秀动画音乐推荐》(http://sobereva.com/496) 《2018年下半年优秀动画音乐推荐》(http://sobere...

使用PSI4做对称匹配微扰理论(SAPT)能量分解计算

使用PSI4做对称匹配微扰理论(SAPT)能量分解计算 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Dec-24  Last update: 2020-Oct-15 1 前言 能量分解方法之前我在《Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览》(http://sobereva.com/252)中简单介绍过。能量分解就是将片段间相互作用能分解成不同物理成分,从而能从能量角度更深入地了解相互...

通过轨道离域指数(ODI)衡量轨道的空间离域程度

通过轨道离域指数(ODI)衡量轨道的空间离域程度 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Dec-22  Last update: 2020-Mar-22 1 前言 轨道的离域程度就是指轨道分布的范围是比较窄还是比较广,分布范围越大可以说离域性越强。有人在思想家公社QQ群里发了几个轨道图片,问怎么衡量他这几个轨道的离域程度,即谁离域相对比较强一些。有很多情况直接看轨道图形就可以直接比...

一篇最全面、系统的研究新颖独特的18碳环的理论文章

后记:后来笔者在此文的研究的基础上做了大量扩展和深化,发表了一系列论文,并且还做了很多其它的与18碳环及其类似物有关的研究,汇总见http://sobereva.com/carbon_ring.html。非常欢迎阅读和引用其中的文章! 一篇最全面、系统的研究新颖独特的18碳环的理论文章 Sobereva@北京科音 First release: 2019-Dec-15  Last update: 2020-Jan-3 ...

将Multiwfn计算的键级直接标注在分子结构图上的方法

将Multiwfn计算的键级直接标注在分子结构图上的方法 文/Sobereva@北京科音  2019-Dec-4 有人在Multiwfn中文论坛上问怎么把Multiwfn计算的键级直接标注在分子结构图上,以便于直观观看。将Multiwfn与GaussView结合使用就可以很方便地实现这一点,在本文介绍一下。读者必须使用2019-Dec-4及以后更新的Multiwfn版本,可以在其官网http://sobereva.com/mult...

计算分子内氢键键能的几种方法

计算分子内氢键键能的几种方法 文/Sobereva@北京科音  2019-Nov-23 0 前言 计算分子间弱相互作用,包括计算最常被研究的氢键的键能,已经有非常成熟、准确的方法,比如最常用的就是用CCSD(T)等高精度方法,拿复合物的能量减各个单体的能量。有时我们需要研究分子内氢键的键能,但计算方法并不唯一,哪种方法最合理也争议颇多,没有普遍的共识,而且本身这也不是实验上可以测定的。尽管如此,由于研究分子内氢键键能在很多方面(...

Grimme的xtb程序的编译方法

Grimme的xtb程序的编译方法 文/Sobereva@北京科音  2019-Nov-21 之前笔者在《将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析》(http://sobereva.com/421)中已经对xtb程序的基本情况进行了介绍,也说明了安装方法。通常直接用预编译版的xtb就够了,但有时候为实现特殊目的需要改代码,这就需要自己编译了。本文介绍一下在CentOS 7.4下的编译。机子...

2019年10月完结动画简评

2019年10月完结动画简评 文/Sobereva  2019-Nov-13 本文是笔者完整观看过的2019年10月完结的21部全长TV版动画和3部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份,怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话(扫番过程的粗略观感在http://bbs.keinsci.com/forum-68-1.html里的相应帖子里写了),没追的要么是笔者对其题材有抗拒(比如恐怖或者胡搞类),要么...

使用Multiwfn计算AV1245指数研究大环的芳香性

2020-Sep-14后记:本文中关于多中心键级计算耗时的说法已经完全过时了。因为从2020-Sep-12更新的Multiwfn开始,程序中实现了笔者提出的一种超快的多中心键级计算算法,而精度没有丝毫损失,对于哪怕含有几十个原子的环也可以非常快速地计算多中心键级,这使得多中心键级的应用范畴有了革命性的扩展。相比之下,AV1245的实际价值就已经不大了。 使用Multiwfn计算AV1245指数研究大环的芳香性 文/Sobereva@北京科音...

谈谈如何衡量分子的极性

谈谈如何衡量分子的极性 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Oct-16  Last update: 2020-Sep-29 0 前言 经常有人问怎么衡量分子的极性,是不是算个偶极矩就可以。实际上,极性是一个非常含糊的概念。从本质上来说,极性来自于净电荷分布的不均匀性,不均匀性越大则极性越强,而分布完全均匀就没有极性。至于极性这个概念怎么才能严格定量反映出来,这没有唯一答案,不同...

将Gaussian等程序收敛的波函数作为ORCA的初猜波函数的方法

注:使用本文方法的读者不要使用2020-Jun-1之前发布的Multiwfn,老版本在一些情况下有bug。 将Gaussian等程序收敛的波函数作为ORCA的初猜波函数的方法 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Oct-11  Last update: 2020-Aug-12 1 说明 ORCA是非常强大的量子化学程序,笔者之前也写过不少相关文章,开发了不...

关于为什么Multiwfn算的出RESP电荷与Antechamber的有所差异

关于为什么Multiwfn算的出RESP电荷与Antechamber的有所差异 文/Sobereva@北京科音 2019-Sep-27 0 前言 RESP电荷的原理、细节以及计算在《RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算》(http://sobereva.com/441)有详细说明,Multiwfn是计算RESP电荷最方便易用和灵活的程序。有Multiwfn用户发现,Multiwfn算出的某些分子的RESP电荷与ant...

谈谈18碳环的几何结构和电子结构

后记:笔者后来在18碳环方面开展了大量研究工作,并陆续发表了许多论文,汇总见http://sobereva.com/carbon_ring.html。本文的读者请务必一看,非常欢迎阅读和引用其中的文章! 谈谈18碳环的几何结构和电子结构 On the geometry and electronic structure of cyclo[18]carbon  文/Sobereva (Tian Lu) @北京科音 ...