通过SMD溶剂模型描述离子液体溶剂环境的方法 文/Sobereva @北京科音  2018-Aug-7 离子液体已被广泛作为溶剂。常有人问离子液体溶剂环境怎么在量子化学计算中体现，本文就专门说一下。阅读本文之前务必先阅读《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》（http://sobereva.com/327）了解基础知识。 1 原理 Truhlar搞出来的SMD溶剂模型是一种比较普适的隐式溶剂模型。原理上...

2018年7月完结动画简评 文/Sobereva  2018-Aug-1 本文是笔者完整观看过的2018年7月完结的25部全长TV版动画和6部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份，怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话，没追的要么是笔者对其题材有抗拒（比如恐怖或者胡搞类），要么就是制作质量太差、太低俗、太粗野、内容太老套、太平庸、太莫名其妙等作品自身问题。 全长番一般评分区间是90~95分（低于90分根本不追，超过95...

使用Multiwfn计算激发态之间的密度差 文/Sobereva @北京科音  2018-Jul-28 1 前言 使用Multiwfn计算密度差、绘制各种密度差图形非常简单，在《使用Multiwfn作电子密度差图》（http://sobereva.com/113）中有充分示例，其中也包括绘制激发态与基态间的密度差，这对于讨论电子跃迁过程中的电子转移特征很有意义。对Multiwfn稍有了解的人肯定也都明白，通过Multiwfn同样...

2018年上半年优秀动画音乐推荐 文/Sobereva  2018-Jul-7 这是第8次写“优秀动画音乐推荐”系列文章，此系列从2014年起不断发布，致力于尽自己微薄之力，令最杰出、最美妙的音乐能有出头之地，而不被数目是它们20倍以上的海量的平庸、凑数的音乐埋没。之前的动画音乐推荐见 《2017年下半年优秀动画音乐推荐》（http://sobereva.com/405） 《2017年上半年优秀动画音乐推荐》（http://sobereva...

适合理论、计算化学投稿的期刊及其2017年影响因子（2018年公布） 文/Sobereva @北京科音  2018-Jun-30 未经授权，严禁转载 此文对适合理论、计算化学投稿的期刊进行罗列，并附上2018年6月公布的2017年影响因子(IF)。 文中期刊名称一般用标准缩写，括号里面是常用首字母简称或者全名，之后是ISSN号。斜杠前是2017年的两年期影响因子（即一般所谓的影响因子），斜杠后是撰此文时的最新中科院分区。有些新...

使用Multiwfn计算分子的长宽高以及显示分子的主轴 文/Sobereva @北京科音   2018-Jun-10 0 前言 经常有人问怎么计算分子的长宽高，之前笔者在《谈谈分子半径的计算和分子形状的描述》（http://sobereva.com/190）一文中也曾讨论分子的长宽高怎么算，但那个博文用的蒽的例子过于简单，而实际分子形状往往比较复杂，而且结构文件里的分子的朝向可能歪斜着，没法直接用那篇博文里的做法。2018...

使用Multiwfn+VMD以原子着色方式表现原子电荷、自旋布居、电荷转移、简缩福井函数 文/Sobereva @北京科音   2018-Jun-3 0 前言 在图像中表现原子电荷分布、原子自旋布居的时候通常都是将数值标在原子上面，但当原子很多的时候，就会导致图像上的数字密密麻麻，难以辨认，而且也不好直观去考察。有一种做法可以解决这个问题，就是通过原子的颜色来表现其原子电荷、自旋布居等属性的正负和大小，这样非常直观。...

谈谈温度、压力、同位素设定对量子化学计算结果产生的影响 文/Sobereva @北京科音  2018-Jun-1 经常有量子化学初学者问诸如这种问题：怎么计算特定温度/压力下体系的结构、重水和轻水的结构有什么区别。每次回复都比较麻烦，索性写一个小文章专门谈一下温度、压力、同位素设定会对哪些常见的量子化学问题计算结果产生影响、对哪些完全没有影响。为讨论方便，这里假定用户用的是Gaussian，其可以通过pressure、temperat...

图比较多，请耐心等待加载... 2018年（第八届）传媒大学春日舞台祭杂谈、照片和录像 图+文+视频/Sobereva  2018-Jun-1 第八届传媒大学春日舞台祭于2018年5月13日于帝都的传媒大学举办。这已经是笔者第三次参加传媒大学春日舞台祭了。前两次都给我留下了深刻印象，演出真的十分良心，诚意满满，整体水准很高，所以这次自不必说也参加了。这次果然也没令我失望，保持了一贯的高质量，内容也是说、唱、跳、演都有，是综合性...

将Gaussian与ORCA联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析 文/Sobereva @北京科音  2018-May-31   1 前言 在《将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析》（http://sobereva.com/421）中笔者介绍了Gaussian的external功能的使用，以及如何利用这个功能，借用xtb程序产生的能量、受力、Hessian来进行...

注：本文的脚本支持的是2019-Apr-18更新的xtb，对更老版本不兼容，对之后的版本可能兼容也可能不兼容，发现不兼容时请自行修改脚本或者用之前的版本。 将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析  文/Sobereva @北京科音 First release: 2018-May-29  Last update: 2019-Apr-18 0 前言 ...

2018年度计算化学公社杯最常用的量子化学程序和DFT泛函投票结果统计 文/Sobereva @北京科音  2018-May-27 在2018年4月16号，在著名的计算化学公社论坛(http://bbs.keinsci.com)开展了为期一个月的“你最常用的量子化学程序投票”（http://bbs.keinsci.com/thread-9713-1-1.html）和“你最常用的DFT泛函投票”（http://bbs.keinsci....

高性价比热力学组合方法G4(MP2)-6X的计算方法 文/Sobereva @北京科音  2018-May-26 在2011年，J. Chem. Theory Comput., 7, 112-120中，几个非Gn系列方法的官方人员提出了G4(MP2)-6X热力学组合方法，号称耗时与G4(MP2)相仿佛，而精度很接近昂贵得多的G4。其相对于G4(MP2)最主要变化是把MP2换成了SCS-MP2，把CCSD(T)的CCSD和(T)部分的相...

利用布居分析判断基函数与原子轨道的对应关系 文/Sobereva @北京科音  2018-May-26 0 前言 波函数分析程序Multiwfn (http://sobereva.com/multiwfn)的很多分析，比如计算分子轨道中某些原子轨道所占成分（见《谈谈轨道成份的计算方法》http://sobereva.com/131）、绘制PDOS图（见Multiwfn手册4.10节的例子）等等都需要在理解基函数与原子轨道的...

PS: 本文图非常多，20多MB，请非常耐心等待加载... 在大阪拍的“百合展2018”照片 摄影/Chris  文/Sobereva  2018-May-14 之前看到一个百合展预告http://acg.178.com/201803/315211303529.html，在四月份大阪有个“百合展2018”，而且有很多知名作家会参展。虽然Sobereva非常想去，但由于诸事繁忙，抽身不得，于是托正巧要在日本一游的人去百合展把照片都拍了回来...