使用NWChem做分数占据数的DFT计算

使用NWChem做分数占据数的DFT计算 文/Sobereva   2017-Feb-25 1 前言 分数占据数(Fractional occupation number, FON)计算是指被计算的体系总电子数不为整数。这看似有点超现实,实际中体系电子数不可能为非整数,毕竟电子不可分割,但对于DFT(或HF)计算是可以实现的,而且在程序实现上超简单。大家知道,常规DFT计算的时候都是已知电子数,根据每一轮迭代时解出的KS轨道能量从低往高填充...

使用Multiwfn通过LOBA方法计算氧化态

使用Multiwfn通过LOBA方法计算氧化态 文/Sobereva  2017-Feb-22 1 原理 讨论化学体系中的原子,特别是配合物中的金属的时候经常用到氧化态(oxidation state)这个概念。这是完全人为的概念,不是可观测的。用氧化态这个概念时相当于假定所有键都是纯粹的离子键,电子在原子间转移量是精确的整数。显然,这个假定对绝大多数情况都是极为糟糕的。懂量子化学的人不爱用氧化态这个虚构的概念,因为原子电荷能明显能更真实客观地描述...

谈谈计算第一超极化率的双能级公式

谈谈计算第一超极化率的双能级公式 文/Sobereva  2017-Feb-21 SOS是计算(超)极化率常用方法之一,介绍见: 使用Multiwfn基于完全态求和(SOS)方法计算极化率和超极化率 http://sobereva.com/232 双能级公式是对SOS简化而来的。研究D-A体系的第一超极化率(β)问题时,研究者总喜欢用双能级公式来解释β值的内在本质,以及解释对体系做不同修改(如替换不同原子或基团)时β的变化趋势。双能级公式表示为: ...

2016年优秀动画音乐推荐

2016年优秀动画音乐推荐 文/Sobereva  2017-Feb-16 这是第5次写“优秀动画音乐推荐”系列文章,此系列从2014年起不断发布,之前的见 《2014年上半年优秀动画音乐推荐》(http://sobereva.com/244) 《2014年下半年优秀动画音乐推荐》(http://sobereva.com/279) 《2015年上半年优秀动画音乐推荐》(http://sobereva.com/299) 《2015年下半年优秀动画音乐推荐》(htt...

2016年Lovelive!海量精选同人图合集

Sobereva无数年前开始就有每日去最大的同人图网站pixiv(http://www.pixiv.net)扫图的习惯,早已是雷打不动的每日必做的事情,每天都得花费至少看一话新番的时间去把当日排名至少前350的图都仔细扫一遍,保存下来精选的。日均收图60张。 这里笔者将2016年1月1日至2016年12月31日期间从p站上精选的Lovelive!同人图发在这里,0.99GB。各个角色各种CP都有,总共4331张,包括1600多张sunshine的,下载地址:http://pa...

2016年度完结动画总评

2016年度完结动画总评 文/Sobereva   2017-Jan-25 此文对笔者完整看过的2016年度完结的101部TV动画(含24部泡面番)进行总评。剧场版、OVA之类的都没有纳入其中。此文只有“2017年1月完结”部分是新写的,4月、7月、10月完结的动画的评论在作品刚完结之时就已经写好并发在了blog上,在此文只是汇总而已(所以有些文字现在看起来已经out了),不过很多作品的总评分为了保持评价的一致性,在此文又做了微调。前几年的总评见: 20...

第二届北京科音分子动力学与GROMACS培训班的通知

本次培训详情请进入此链接查看: http://www.keinsci.com/workshop/2KGMX.html 简介 北京科音自然科学研究中心(www.keinsci.com)将于2017年3月16日至19日于北京开办“第二届北京科音分子动力学与GROMACS培训班”。 分子动力学方法自诞生至今已有半个世纪的历史,是分子模拟技术的关键组成,如今在溶液、生物大分子、聚合物、无机材料、纳米技术等研究领域中已成为不可或...

公共场合使用大字号发言是没素质的行为

公共场合使用大字号发言是没素质的行为 文/Sobereva   2016-Nov-18 笔者常年在思想家公社QQ群里答疑,最反感的情况前三位之一就是发言者用大的字号(其它两个,是用“好吧”做句子开头和求sci-hub能下的文献) 来看典型例子 大字号发言往往一行就顶人家三四、四五行!一次发言就足够把屏幕全占满了,往往一屏还显示不下,造成严重刷屏!上面看到的是...

谈谈学量子化学如何正确地入门

谈谈学量子化学如何正确地入门 文/Sobereva  2016-Nov-12 量化的重要性已经被越来越多的人认知,步入量化研究领域的新人的增长速度也在不断迅猛增加,量化研究群体也越来越大。无数从事量化研究的新人在入门过程中摸不到门路,白花了很大时间、绕了很大弯路,吃了大亏。总是学来学去,没少努力,看了不少乱七八糟资料,结果量化关键性的基础知识和程序基础操作还是没正经学明白,思维脉络一团浆糊,文章更是出不来,往往还陷入延期毕业的惨剧。笔者常年天天在网上答疑,这样的...

谈谈如何又好又快地计算NMR化学位移

谈谈如何又好又快地计算NMR化学位移 文/Sobereva   2016-Nov-10 本文重点介绍一种又便宜又准确的计算有机分子13C和1H化学位移的方法,英文叫scaling,笔者把它翻译成标度法。第一节首先会说一些和NMR计算有关的乱七八糟的知识,然后在第二节介绍标度法,最后在第三节给个实例对比标度法相对于一般计算方式的优势。 1 相关知识 量子化学程序计算NMR时会计算每个原子核位置的磁屏蔽张量,这是3*3矩阵,表现出原子核附近的...

谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算

谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算 文/Sobereva  2016-Nov-9 自旋密度和自旋布居都是量化里非常重要也很简单的概念。鉴于很多初学者总是问相关的问题,这里专门说说其概念以及怎么计算。 1 自旋密度 1.1 基本概念 对于开壳层体系,Alpha电子密度分布和Beta电子密度分布是不同的,为了考察未配对电子(或者说单电子)在三维空间中的分布情况,定义了自旋密度(Spin density)的概念: ...

第一届北京科音初级量子化学培训班的通知

北京科音自然科学研究中心将于2016年12月3日~6日于北京开办“第一届北京科音初级量子化学培训班”,现接受报名,上限64人,报满即止。 本次培训专门给零基础初学者开设,是以最正规、最正确的方式一次性从完全零基础起步的最难得的机会。完全不用担心听不懂。之前参加过基础班如果觉得吃力,没怎么听明白的话,参加这个班也很适合。上过一次后常见化学问题都能用Gaussian正确合理地算出来(但如果想对更多问题都能又快又准、炉火纯青地计算,需要参加过初级班,再通过实际研究积累一些“感觉”后,参...

C3 Beijing 2016 + IDO 19联展杂谈 Part2:所购之物&Cosplay

此文为杂谈第2部分,本文第1部分(现场演出&手办照片)见http://sobereva.com.com/350 C3 Beijing 2016 + IDO 19联展杂谈 Part2:所购之物&Cosplay 文/Sobereva(3)  2016-Oct-17 C3上销售摊位不多,以手办和原版周边为主,价格普遍比较高。IDO算是综合性展吧,同人本很难见到,故本子只买了一个。 下面是联展中买的东西。 经常在B站新番上看到的版权方羚邦的展台买的...

C3 Beijing 2016 + IDO 19联展杂谈 Part1:现场演出&手办照片

PS:图非常多,139张,请耐心缓冲 此文为杂谈第1部分,本文第2部分(所购之物&Cosplay)见http://sobereva.com/351 C3 Beijing 2016 + IDO 19联展杂谈 Part1:现场演出&手办照片 文/Sobereva(3)  2016-Oct-17 2016年10月2日去了国家会议中心的C3 Beijing 2016 + IDO 19联展。这是日本著名的模型展C3第一次在中国办,当然规模肯定没法跟本土...

2016年10月完结动画简评

2016年10月完结动画简评 文/Sobereva (2)+(3)  2016-Oct-6 本文是笔者完整观看过的2016年10月完结的21部全长TV版动画和2部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份,怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话,没追的要么是笔者对其题材有抗拒(比如恐怖或者胡搞类),要么就是制作质量太差、太低俗、太粗野、内容太老套、太平庸、太莫名其妙等作品自身问题。 《Days》和《齐木楠雄的灾难》还没完结,正...