[置顶] 第十届北京科音初级量子化学培训班的预告(2019年10月4~7日,北京)

北京科音自然科学研究中心(http://www.keinsci.com)将于2019年10月4~7日举办“第十届北京科音初级量子化学培训班”。报名将于2019年9月12日中午12:00在北京科音官网http://www.keinsci.com开始,推荐关注“北京科音”微信公众号避免错过时间。第十届培训的正式通知将在报名开始时在北京科音官网公布,欲参加者可以参考往届(第九届)的培训正式通知: http://www.keinsci.com/workshop/9KEQC ...

谈谈我对计算化学代算的看法

谈谈我对计算化学代算的看法 文/Sobereva   2019-Aug-20 时常有人在群里、论坛里,或者直接邮件问我,他要算***问题,哪里可以提供计算化学代算、哪里有靠谱的。我以前专门做过两年多代算,接过的代算任务有将近90个,对于代算这方面我觉得我还是比较有发言权的,所以在此文我说说我对代算的看法。顺带一提,我早已不再接任何代算了,而是提供计算化学的培训(见http://www.keinsci.com的“科研培训”栏目)。授...

VMD里原子选择语句的语法和例子

VMD里原子选择语句的语法和例子 文/Sobereva@北京科音   2019-Aug-19 1 前言 VMD(http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/)是极其强大、灵活的化学体系可视化程序,笔者之前也写过不少相关文章,见http://sobereva.com/category/VMD/。VMD的选择语句(selection)用来选择满足特定要求的体系中的原子,其用法极度简单灵活,对于VM...

使用Multiwfn计算分子的动力学直径

使用Multiwfn计算分子的动力学直径 文/Sobereva@北京科音  2019-Aug-19 1 相关知识&计算原理 分子直径有很多不同定义。在分子分离研究领域中经常用动力学直径(kinetic diameter)体现分子尺寸,这个量没有一般性的方法,直到现在,主要来源还是Breck很老的1974年的Zeolite Molecular Sieves; Structure, Chemistry and Use一书,数...

使用Multiwfn考察分子轨道、NBO等轨道对密度差、福井函数的贡献

使用Multiwfn考察分子轨道、NBO等轨道对密度差、福井函数的贡献 文/Sobereva@北京科音  2019-Aug-17 1 前言&基本知识 密度差是量子化学研究中经常被考察的量,Multiwfn可以非常容易地计算和绘制各种类型的密度差,见《使用Multiwfn作电子密度差图》(http://sobereva.com/113)。福井函数本质上也是密度差的一种,对于预测反应位点非常有实际价值,在http://bbs...

使用Multiwfn计算Bond length/order alternation (BLA/BOA)和考察键长/键级随键序号的变化

使用Multiwfn计算Bond length/order alternation (BLA/BOA)和考察键长/键级随键序号的变化 文/Sobereva@北京科音  2019-Aug-11 1 基本知识 共轭寡聚物是量子化学经常研究的对象,如10聚乙烯、12聚噻吩等。这类体系都有共轭长链,pi电子能够在上面长程离域。这种共轭链上的键长通常呈现交替变化特征,即长-短-长-短...,相应地,键级的变化也有类似的交替波动规律。为展现...

使用了Multiwfn发表的第3001~4000篇文章打包下载

截止到2019年8月11日,引用Multiwfn的文章已达4000篇。这是第3001~4000篇使用了Multiwfn程序发表的文章的全文pdf合集,下载地址:https://pan.baidu.com/s/16snA2J0HBBS1V2fPYL3Acg 这是此文件包里所有文件的列表: list.txt 由于本文件包里绝大部分文章都是它们刚在期刊网站上作为ASAP刊登的时候我就下载的,所以文档中大多没有页码、卷号,大家只要到google学术...

使用Multiwfn计算与超瑞利散射(HRS)实验相关的量

使用Multiwfn计算与超瑞利散射(HRS)实验相关的量 文/Sobereva@北京科音  2019-Aug-7 摘要:超瑞利散射(HRS)是考察分子第一超极化率的一种实验手段,本文介绍如何使用Multiwfn基于Gaussian的polar任务的输出文件计算出与HRS实验相关的量。首先介绍基础知识,然后给出具体例子,并重复文献里的数据。 1 基本知识 之前笔者在《使用Multiwfn分析Gaussian的极化率...

OfakeG:使GaussView能够可视化ORCA输出文件的工具

OfakeG:使GaussView能够可视化ORCA输出文件的工具 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Jul-17  Last update: 2019-Aug-8 1 前言 量子化学程序ORCA用的人越来越多,功能很强大而且免费,用户数在所有量化程序中已经是第二高(虽然跟Gaussian比还遥不可及)。但至少在笔者撰写此文时,相对于用户数占绝对主导地位的Gaussian程序而...

2019年7月完结动画简评

2019年7月完结动画简评 文/Sobereva  2019-Jul-16 本文是笔者完整观看过的2019年7月完结的17部全长TV版动画和5部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份,怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话(扫番过程的粗略观感在http://bbs.keinsci.com/forum-68-1.html里的相应帖子里写了),没追的要么是笔者对其题材有抗拒(比如恐怖或者胡搞类),要么就是...

2019年上半年优秀动画音乐推荐

2019年上半年优秀动画音乐推荐 文/Sobereva  2019-Jul-12 这是第10次写“优秀动画音乐推荐”系列文章,此系列从2014年起不断发布,致力于尽自己微薄之力,令最杰出、最美妙的音乐能有出头之地,而不被数目是它们20倍以上的海量的平庸、凑数的音乐埋没。之前的动画音乐推荐见 《2018年下半年优秀动画音乐推荐》(http://sobereva.com/459) 《2018年上半年优秀动画音乐推荐》(http://sobere...

我看过的所有TV版动画列表

我看过的所有TV版动画列表 文/Sobereva 2019-Jul-11 之前洒家一直有个习惯,就是每一季动画完结后,都把下载的动画刻成DVD,到现在已经刻了800张盘左右了,一共九大包(其中还有大约10%的古老数据是应用程序、PC游戏之类其它乱七八糟的)。考虑到如今大容量移动硬盘已经很便宜了,而刻盘这种方式不仅麻烦(每次都得想办法把一张盘尽量恰好凑满)、花时间、占地方,而且据说时间长了容易有些盘难以读出来(有说法是保存寿命也就十几年),而且资料检索...

2019年上半年观看的非TV版动画简评

2019年上半年观看的非TV版动画简评 文/Sobereva  2019-Jul-7 这是洒家对从2019年1月1日开始截止到2019年6月30日观看过的非TV版动画进行的简单评论。还有些此类动画看完后忘写了,就也不再补了。由于这类动画不好对比和打分,我也就不给出评分了。以往的此系列文章和TV版动画评论见http://sobereva.com右方的“动画评论”分类。 肆式青春 类型:剧场动画 长度:1h14m 此作制作相当不错...

绘制静电势全局极小点+等值面图展现孤对电子位置的方法

绘制静电势全局极小点+等值面图展现孤对电子位置的方法 文/Sobereva@北京科音  2019-Jun-24 1 前言 有人在计算化学公社论坛问下面这张图怎么绘制(实际上是J. Comput. Chem., 39, 488 (2017)里的图) 这张图里面每个黑点是静电势的全局极小点,蓝色网格等值面展现的是静电势的等值面图,如图题所示,等值面数值取的是比静电势全局最小点数值(Vmin)大10 kca...

适合理论、计算化学投稿的期刊及其2018年影响因子(2019年公布)

适合理论、计算化学投稿的期刊及其2018年影响因子(2019年公布) 文/Sobereva @北京科音  2019-Jun-23 未经授权,不得转载 1 前言 此文对适合理论、计算化学投稿的期刊进行罗列,并附上2019年6月公布的2018年影响因子(IF)。这正好是第10次笔者写此系列的文章,往年的文章见本文文末。 文中期刊名称一般用标准缩写,括号里面是常用首字母简称或者全名,之后是ISSN号。斜杠前是2...

考察分子磁感生电流的程序GIMIC 2.0的使用(含24分钟演示视频)

考察分子磁感生电流的程序GIMIC 2.0的使用 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Jun-22  Last update: 2019-Jul-1 1 前言 GIMIC的主要用途是基于量子化学程序的输出信息来计算分子的磁感生电流,这对于考察芳香性尤为重要,见《衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的计算》(http://sobereva.com/176)中的相关介绍。GIMIC可...