使用Multiwfn计算与超瑞利散射(HRS)实验相关的量

使用Multiwfn计算与超瑞利散射(HRS)实验相关的量 文/Sobereva@北京科音  2019-Aug-7 摘要:超瑞利散射(HRS)是考察分子第一超极化率的一种实验手段,本文介绍如何使用Multiwfn基于Gaussian的polar任务的输出文件计算出与HRS实验相关的量。首先介绍基础知识,然后给出具体例子,并重复文献里的数据。 1 基本知识 之前笔者在《使用Multiwfn分析Gaussian的极化率...

OfakeG:使GaussView能够可视化ORCA输出文件的工具

OfakeG:使GaussView能够可视化ORCA输出文件的工具 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Jul-17  Last update: 2019-Aug-8 1 前言 量子化学程序ORCA用的人越来越多,功能很强大而且免费,用户数在所有量化程序中已经是第二高(虽然跟Gaussian比还遥不可及)。但至少在笔者撰写此文时,相对于用户数占绝对主导地位的Gaussian程序而...

2019年7月完结动画简评

2019年7月完结动画简评 文/Sobereva  2019-Jul-16 本文是笔者完整观看过的2019年7月完结的17部全长TV版动画和5部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份,怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话(扫番过程的粗略观感在http://bbs.keinsci.com/forum-68-1.html里的相应帖子里写了),没追的要么是笔者对其题材有抗拒(比如恐怖或者胡搞类),要么就是...

2019年上半年优秀动画音乐推荐

2019年上半年优秀动画音乐推荐 文/Sobereva  2019-Jul-12 这是第10次写“优秀动画音乐推荐”系列文章,此系列从2014年起不断发布,致力于尽自己微薄之力,令最杰出、最美妙的音乐能有出头之地,而不被数目是它们20倍以上的海量的平庸、凑数的音乐埋没。之前的动画音乐推荐见 《2018年下半年优秀动画音乐推荐》(http://sobereva.com/459) 《2018年上半年优秀动画音乐推荐》(http://sobere...

我看过的所有TV版动画列表

我看过的所有TV版动画列表 文/Sobereva 2019-Jul-11 之前洒家一直有个习惯,就是每一季动画完结后,都把下载的动画刻成DVD,到现在已经刻了800张盘左右了,一共九大包(其中还有大约10%的古老数据是应用程序、PC游戏之类其它乱七八糟的)。考虑到如今大容量移动硬盘已经很便宜了,而刻盘这种方式不仅麻烦(每次都得想办法把一张盘尽量恰好凑满)、花时间、占地方,而且据说时间长了容易有些盘难以读出来(有说法是保存寿命也就十几年),而且资料检索...

2019年上半年观看的非TV版动画简评

2019年上半年观看的非TV版动画简评 文/Sobereva  2019-Jul-7 这是洒家对从2019年1月1日开始截止到2019年6月30日观看过的非TV版动画进行的简单评论。还有些此类动画看完后忘写了,就也不再补了。由于这类动画不好对比和打分,我也就不给出评分了。以往的此系列文章和TV版动画评论见http://sobereva.com右方的“动画评论”分类。 肆式青春 类型:剧场动画 长度:1h14m 此作制作相当不错...

绘制静电势全局极小点+等值面图展现孤对电子位置的方法

绘制静电势全局极小点+等值面图展现孤对电子位置的方法 文/Sobereva@北京科音  2019-Jun-24 1 前言 有人在计算化学公社论坛问下面这张图怎么绘制(实际上是J. Comput. Chem., 39, 488 (2017)里的图) 这张图里面每个黑点是静电势的全局极小点,蓝色网格等值面展现的是静电势的等值面图,如图题所示,等值面数值取的是比静电势全局最小点数值(Vmin)大10 kca...

适合理论、计算化学投稿的期刊及其2018年影响因子(2019年公布)

适合理论、计算化学投稿的期刊及其2018年影响因子(2019年公布) 文/Sobereva @北京科音  2019-Jun-23 未经授权,不得转载 1 前言 此文对适合理论、计算化学投稿的期刊进行罗列,并附上2019年6月公布的2018年影响因子(IF)。这正好是第10次笔者写此系列的文章,往年的文章见本文文末。 文中期刊名称一般用标准缩写,括号里面是常用首字母简称或者全名,之后是ISSN号。斜杠前是2...

考察分子磁感生电流的程序GIMIC 2.0的使用(含24分钟演示视频)

考察分子磁感生电流的程序GIMIC 2.0的使用 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Jun-22  Last update: 2019-Jul-1 1 前言 GIMIC的主要用途是基于量子化学程序的输出信息来计算分子的磁感生电流,这对于考察芳香性尤为重要,见《衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的计算》(http://sobereva.com/176)中的相关介绍。GIMIC可...

详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能

注:本文内容对应的是2019-Aug-9更新的Multiwfn 3.7(dev)及之后版本 详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能 文/Sobereva@北京科音 First release: 2019-Jun-23  Last update: 2019-Sep-14 1 简介 ORCA量子化学程序如今的用户越来越多,用户数仅次于Gaussian(虽然还有一个数量级的差距),不仅...

为什么我非常不建议购买和使用阿DF量子化学程序

为什么我非常不建议购买和使用阿DF量子化学程序 2019-Jun-2 网上偶尔看见有人问阿DF哪里买,该不该用之类的问题,每次去解释太麻烦,我这里专门写一个文章说说我对阿DF的看法。简单一句话就是:绝对别买阿DF,绝对别用阿DF! 虽然我并没怎么亲自用过阿DF,也就是以前短暂玩过一把,但我根据我已知的关于阿DF的信息、阿DF手册以及我的量子化学知识的积累,我不认为此文会有显著误导性。虽然可能有不准确的地方,但是我敢打包票95%说的都是正确...

谈谈该从Gaussian输出文件中的什么地方读电子能量

谈谈该从Gaussian输出文件中的什么地方读电子能量 文/Sobereva@北京科音   2019-Jun-1 1 前言 在网上答疑时,经常看到有Gaussian初学者问诸如“我要算xxx,是不是用HF能量”、“我应该用SCF Done能量对比么?”。这种问法被内行人看了很烦,完全是根本没入门、没常识的问法,回答他本来想问的问题前还得先给对方科普一下从输出文件里该读什么数据。鉴于每次都科普一遍太麻烦、甚至都...

使用Multiwfn和VMD计算分子表面积和片段表面积

使用Multiwfn和VMD计算分子表面积和片段表面积 文/Sobereva@北京科音  2019-May-27 时常有人问怎么计算分子表面积、怎么计算基团的表面积,其实这用Multiwfn或VMD来做非常简单,这里就结合例子简单说一下。 1 关于分子表面的定义 首先要清楚定义表面积的方式非常多,在《谈谈分子体积的计算》(http://sobereva.com/102)一文中就已经提到了好几个。其中有一个叫做SASA...

Multiwfn 3.6正式版隆重发布!

Multiwfn 3.6正式版隆重发布! 文/Sobereva @北京科音  2019-May-21 Multiwfn的上个正式版3.5是2018年4月16日发布的,经过近一年有余的不断改进和完善,Multiwfn 3.6正式版终于正式发布!目前已经可以在官网上http://sobereva.com/multiwfn下载。 近一年来Multiwfn更新极度频繁,带(dev)后缀的开发版在Multiwfn官网上甚至有时候...

使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量

使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量 文/Sobereva@北京科音  2019-May-21 1 前言 由Parr最初开始发展的概念密度泛函理论(Conceptual density functional theory,CDFT)也称密度泛函反应性理论(DFRT),是量子化学和波函数分析领域中的一个重要组成,专门用来预测和解释化学物质的反应活性、反应位点等问题,对于研究化学反应有重要意义。相关介绍...