适合理论、计算化学投稿的期刊及其2019年影响因子(2020年公布)

适合理论、计算化学投稿的期刊及其2019年影响因子(2020年公布) 文/Sobereva @北京科音  2020-Jul-4 未经授权,不得转载 1 前言 此文对适合理论、计算化学投稿的期刊进行罗列,并附上2020年6月末公布的2019年影响因子(IF)。本文对于读者了解有哪些期刊值得平时关注也有一定意义。这是第11次笔者写此系列的文章,往年的文章见本文文末。 文中期刊名称一般用标准缩写,有的给出了常用首...

2020年上半年观看的非TV版动画简评

2020年上半年观看的非TV版动画简评 文/Sobereva  2020-Jul-4 这里对从2020年1月1日开始截止到2020年6月30日观看的非TV版动画进行简单评论。由于这类动画不好对比和打分,我也就不给出评分了。以往的此系列文章和TV版动画评论见http://sobereva.com右方的“动画评论”分类。 紫罗兰永恒花园外传 类型:剧场版 长度:90m44s 此作能在国内上映,而且还是日本播放后才几个月就能在国内上映...

使用Multiwfn计算分子片段的偶极矩和复合物中单体的偶极矩

使用Multiwfn计算分子片段的偶极矩和复合物中单体的偶极矩 文/Sobereva@北京科音  2020-Jun-23 1 原理 时不时有人问怎么计算一个分子中某些片段的偶极矩,或者问怎么计算一个分子复合物中各个分子的偶极矩,确实这对于分析局部的极性很有意义,在本文就通过例子对做法进行说明。做这种分析必须使用2020-Jun-22之后更新的Multiwfn程序,可以在http://sobereva.com/multiwfn免费...

谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的

谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的 文/Sobereva@北京科音 First release: 2020-Jun-11  Last update: 2020-Nov-17 1 前言 量子化学研究中什么场合用什么DFT泛函合适,在《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》(http://sobereva.com/272)中我已经说过了。量子化学研究中最常见的两类任务就是单点能的计算和几何优化...

在Comiket 97漫展入手的二次元物 Part 2

在Comiket 97漫展入手的二次元物 Part 2 文/Sobereva   2020-Jun-7 本文的part 1见http://sobereva.com/555。 其它同人本 舰娘本子。一个是以舰娘们自制各种简单又美味的食物为题材,里面有些东西令我跃跃欲试,另一个是讲舰娘们打棒球过程中的搞笑事情 自从《兽娘动物园》播出之后,薮猫就火了,...

在Comiket 97漫展入手的二次元物 Part 1

在Comiket 97漫展入手的二次元物 Part 1 文/Sobereva   2020-Jun-7 由于此文图太多,总共有约120张图,为避免加载太慢,分成两个part发。part 2见http://sobereva.com/556。 2019年年末终于有机会去了在东京办的世界规模最大的漫展,12月28~31日举办的Comiket 97,这也是全世界ACG爱好者们终极的朝圣的地方。这里把当时买的ACG东...

谈谈量子化学中什么样的benchmark才有意义

谈谈量子化学中什么样的benchmark才有意义 文/Sobereva@北京科音  2020-Jun-5 1 前言 笔者在计算化学公社论坛、思想家公社QQ群解答量子化学相关问题时,经常看到有些对理论方法知之甚少、没读过什么文献的初学者在自己的研究中乱做benchmark,还管这叫“标定”,甚至一些初学者竟然以为所谓的标定总是要做。他们所做的事几乎纯粹是在浪费计算资源,每次我都得苦口婆心地劝他们别瞎做无用功。在本文,我就再专门说一...

通过设置CPU内核绑定降低ORCA同时做多任务的耗时

通过设置CPU内核绑定降低ORCA同时做多任务的耗时 文/Sobereva@北京科音   2020-Jun-1 1 前言 由于任何程序的并行效率都是随着核数增加而降低,当机子核数比较多的时候,比如有好几十核,而且又有许多任务要跑的时候,比起一个一个调用所有核心来跑,同时跑两个或者多个任务但是每个都用较少的核心数(总和不超过物理核心数),总耗时通常会更低。对于某些程序跑某些任务,甚至并行核数较少的时候反倒比核数较多的时候...

使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据

使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据 文/Sobereva@北京科音 First release: 2020-May-19  Last update: 2020-Sep-15 1 前言 在日常量子化学研究中,计算焓、熵、自由能等热力学数据是最常涉及的问题。主流量子化学程序如Gaussian、ORCA等都自带了振动分析功能,在任务结束后会自动给出热力学数据。但是用这些程序来获得热力学数据往往...

谈谈范德华势以及在Multiwfn中的计算、分析和绘制

谈谈范德华势以及在Multiwfn中的计算、分析和绘制 文/Sobereva@北京科音  First release: 2020-May-2  Last update: 2021-Mar-2 0 前言 在研究分子间弱相互作用领域,静电势是经常被考察的量。通过静电势我们可以方便、直观地了解分子的什么地方倾向于与带有什么电荷的物质(或局部)相互作用,可以对结合强度、结合方式进行解释和预测。关于静电势笔者写过大量...

在Gaussian中自定义范围分离泛函的方法

在Gaussian中自定义范围分离泛函的方法 文/Sobereva@北京科音   2020-May-1 0 前言 之前笔者在《优化长程校正泛函w参数的简便工具optDFTw》(http://sobereva.com/346)介绍过长程校正泛函和明显影响其结果的ω参数(以下简写为w)。在Gaussian中对DFT泛函自定义w值的做法在此文里也说了:《Gaussian中非内置的理论方法和泛函的用法》(http://sobe...

使用Multiwfn模拟扫描隧道显微镜(STM)图像

使用Multiwfn模拟扫描隧道显微镜(STM)图像 文/Sobereva@北京科音 First release: 2020-Apr-28  Last update: 2020-May-1 0 前言 扫描隧道显微镜(scanning tunneling microscopy, STM)是非常常用的在原子级别对固体表面或者被吸附在固体表面的分子进行成像的方法。从2020-Apr-27更新的Multiwfn开始,Mul...

2020年4月完结动画简评

2020年4月完结动画简评 文/Sobereva  2020-Apr-12 本文是笔者完整观看过的2020年4月完结的19部全长TV版动画和3部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份,怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话(扫番过程的粗略观感在http://bbs.keinsci.com/forum-68-1.html里的相应帖子里写了),没追的要么是笔者对其题材有抗拒(比如恐怖或者胡搞类),要么就是...

使用Multiwfn通过单位球面表示法图形化考察(超)极化率张量

使用Multiwfn通过单位球面表示法图形化考察(超)极化率张量 文/Sobereva@北京科音  2020-Apr-10 1 前言 如果读者对(超)极化率的概念还不怎么了解的话,建议先看看《使用Multiwfn分析Gaussian的极化率、超极化率的输出》(http://sobereva.com/231)中的相关知识。平时在研究分子的(超)极化率的时候,关注的通常只是总大小,以及X、Y、Z方向的总分量,而对于(超)极化率张量的...

使用了Multiwfn发表的第4001~5000篇文章打包下载

截止到2020年4月1日,引用Multiwfn的文章已达5000篇!下面是第4001~5000篇使用了Multiwfn程序发表的文章的全文pdf合集(其中漏了两篇文章对应的文件,不好找了)。 百度网盘下载地址(速度慢):链接:https://pan.baidu.com/s/1O_ZXTdqbtrbvFDEDt0NmAQ 提取码:uw9h Mega网盘下载地址(适合“有条件”的人下载,速度快):https://mega.nz/#F!mB1Wiaga!bl...