存在感最低的漫展--GTV“lim2.5 D”夏日学园祭游记

存在感最低的漫展--GTV“lim2.5 D”夏日学园祭游记 文/Sobereva(3) 2012-May-7 lim2.5D漫展于2012年5月6日在北京朝阳传媒影视技术服务中心一层举办。这个漫展是我去过的,最最坑爹的漫展,没有之一。展馆位置实在是太隐蔽了,在官方页面说的大黄庄下了公交车,顶着烈日在附近来回走了一个多小时才终于找到场馆!一度令我以为这个漫展是不是临时取消了,毕竟这漫展不收门票钱也不收摊位费,而且是第一次办,地点很不知名,临开展差不多一个...

使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键

后记:Multiwfn从3.4版开始支持了轨道定域化功能,如果没有离域范围很大的AdNDP轨道时可以直接代替AdNDP分析,结果基本相同,但用起来方便得多,详见《Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比》(http://sobereva.com/380)。 使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键 文/Sobereva @北京科音 First release: 2012-May-8...

首个完全基于GPU的量化软件-TeraChem杂谈及真实性能测试

2019-Mar-3注:在文末补充了全新的测试,以反映目前主流硬件下的情况 首个完全基于GPU的量化软件-TeraChem杂谈及真实性能测试 文/Sobereva   2012-Apr-30 TeraChem是第一个公布于世的、完全基于GPU运算的从头算量化程序,2010年5月发布第一版。虽然很早就听说过此程序,但直到近日才终于有机会亲自把玩,此文将杂谈此程序的一些特征,并且实际测试一下此程序的性能,看看到...

绘制跃迁密度矩阵平面图分析电子跃迁

重要提示:此文已经完全过时了,不要再看。读者务必看笔者后来写的《使用Multiwfn绘制跃迁密度矩阵和电荷转移矩阵考察电子激发特征》(http://sobereva.com/436) 绘制跃迁密度矩阵平面图分析电子跃迁 文/Sobereva @北京科音 First release: 2012-Apr-9  Last update: 2018-Jun-10   1 原理 已知两个电子态G、E的波函数,就可...

贼船漫展杂谈、照片和现场演唱/舞蹈录像

贼船漫展杂谈、照片和现场演唱/舞蹈录像 文/Sobereva(3)  2012-Apr-7 贼船漫展于2012年4月2日、3日在国家奥林匹克森林公园羽毛球馆举行。寡人去的是4月2日的。这个漫展属于小规模的,只有2500平米、120个摊位(约大型漫展的1/3),和CP3 beta属于一个级别。在这种小场地进行总是造成在接近12点前后的人流高峰期馆内极为拥挤、燥热,而且照相颇不方便,此次也是。 门票20,没有预售票,只有现场票。前X...

使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道

使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道 文/Sobereva @北京科音 First release: 2012-Apr-4    Last update: 2018-May-24 1 前言 NBO程序输出的轨道包括NBO(自然键轨道)、NHO(自然杂化轨道)、NAO(自然原子轨道)、NLMO(自然定域化分子轨道),以及前头带P的类型,如PNBO(初自然键轨道)。NBO程序输出的plot文件包含了...

初音与灵梦的百合会2演唱会杂谈、照片及录像

初音与灵梦的百合会2演唱会杂谈、照片及录像 文/Sobereva(3)  2012-Mar-27 初音与灵梦的百合会2北京场是寡人第三次参加的ANIMANIA社团的演唱会,于2012年3月25日在麻雀瓦舍进行,票价40,上半场是10:00~12:00。下半场是13:00~16:00(实际结束时间17:00出头)。 看完之后,我怀带着欢乐的心情和腰疼,在坐公交车回家的路上,头脑里冒出一个诡异、看似颇不搭调的想法:如果前不久刚跳楼自杀的...

印了件Multiwfn的T恤

印了件Multiwfn的T恤 文/Sobereva 一直想印个Multiwfn的T恤,以借开会之机给Multiwfn打打隐性广告,犹豫、比较了很久,在http://love3.taobao.com上 定制了一件Multiwfn logo的T恤。只要提供图片文件就能印。用的是热转印方式,印刷质量非常完美,没有丝毫偏色,色彩过渡细腻,看不出色阶,基本没有串入其它任何色点,衣服穿着也挺舒服。而且免费做出了镂空效果,也就是图片的黑色底色区域不被印...

谈谈轨道成份的计算方法

注:本文属于深入、详细的讨论。如果只是着急想马上得到轨道成分计算结果,直接看本文第6节或Multiwfn手册的4.8节的例子即可。   谈谈轨道成份的计算方法 文/Sobereva @北京科音 First release: 2012-Feb-24  Last update: 2018-Nov-17 1 前言 经常有人发帖问怎么计算轨道成份,文献中也经常给出轨道成份,用于讨论电子...

谈谈体数据3:用Multiwfn、Gaussview、Molekel、VMD观看龙虾、盆景、骨盆、大脑

谈谈体数据3:用Multiwfn、Gaussview、Molekel、VMD观看龙虾、盆景、骨盆、大脑 文/Sobereva @北京科音   2012-Feb-22 原本打算标题定为《使用计算化学可视化软件观看与化学无关的体数据》,但感觉太刻板吸引不了眼球,就改成当前这个标题了。这篇帖子是《谈谈体数据》系列文章之三,比较有趣味,将介绍如何用一些常见的计算化学可视化软件,包括GaussView、VMD、molekel,以及...

谈谈体数据2:体数据格式转换工具vodaconv的使用及原理

谈谈体数据2:体数据格式转换工具vodaconv的使用及原理 文/Sobereva @北京科音 First release: 2012-Feb-14  Last update: 2012-Feb-22 前言:在《谈谈体数据1:介绍体数据》(http://sobereva.com/127)一文中寡人介绍了体数据的相关概念。raw是广为通用的体数据储存格式,可惜计算化学领域的可视化软件极少有支持raw格式的;而通用的渲染体数据的程序也没有能支持...

谈谈体数据1:介绍体数据

谈谈体数据1:介绍体数据 文/Sobereva  2012-Feb-12 前言:《谈谈体数据》是一系列帖子,写这些帖子的目的,就是让读者了解什么是体数据,尤其是想让计算化学工作者开阔视野,领会到经常分析的诸如轨道波函数等值面图与计算机图形学领域、医疗成像领域及其它计算科学界涉及的普遍意义的体数据之间的本质联系,能够进而利用比起计算化学领域的可视化软件更强大的通用体数据渲染软件绘制出漂亮乃至艺术级的和化学相关的体数据。 1 体数...

将Gaussian从头算动力学轨迹转换为pdb轨迹的程序GauMDconv

将Gaussian从头算动力学轨迹转换为pdb轨迹的程序GauMDconv 文/Sobereva @北京科音    2012-Feb-10 1.1版下载地址(含windows下可执行文件,源代码,示例):/usr/uploads/file/20150610/20150610023408_87558.rar   简介: 此程序用来将Gaussian的BOMD或ADMP任务产生的...

Gaussian型cube文件简介及读、写方法和简单应用

Gaussian型cube文件简介及读、写方法和简单应用 文/Sobereva @北京科音 First release: 2012-Feb-8  Last update: 2019-May-6 1 前言 格点文件是指记录了空间中各个位置数值的文件。在计算化学界最通用的格点文件格式是Gaussian型cube文件(以下简称cube文件)。它不仅可以由Gaussian程序产生,也可以由很多其它计算化学软...