Amber力场二面角参数的解释

Amber力场二面角参数的解释 文/Sobereva @北京科音    写于约2008年   在xleap中edit parm99时,进入参数修改界面,每个参数都有介绍。在二面角参数设置中,PK/IDIVF就相当于那些amber参数中nonbond项第二列参数(即Vn/2,也称作PK)除以第一列参数的值,第一列代表两端原子数乘积(即redundancy,也称作IDIVF),所以PK/IDIV...