谈谈原子轨道朝向引起的量子化学计算结果与经验观念的差异
On the differences between quantum chemistry calculation results and empirical concepts caused by atomic orbital orientation
文/Sobereva @北京科音 Last update: 2010-Mar-27
我曾在《谈谈5d-6d型d轨道波函数与它们在高斯中...
谈谈5d、6d型d壳层基函数与它们在Gaussian中的标识
On the 5d and 6d type d-shell basis functions and their identification in Gaussian
文/Sobereva@北京科音 Last Update: 2011-Jul-30
在含有d轨道的体系的高斯输出文件中，有时会看到d轨道名以D 0, D+1, D-1, D+2, D-2标识，有人误以为那些轨道就是指复数型真实...
Gaussian 03的Linda并行设置与VMware的虚拟集群
Linda parallel setup of Gaussian 03 and VMware virtual cluster
文/Sobereva @北京科音
First release: 2009-Sep-13 Last update: 2014-Sep-8
网上也有一些关于高斯linda并行设置的文章，也有讨论使用虚拟机模拟的集群跑高斯+linda的，但是说明都不甚具...
谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理
On the BSSE correction and its processing in Gaussian
文/Sobereva @北京科音
First release 2009-Aug-27 Last update: 2018-Jul-5
计算A、B分子间的弱相互作用能时，一般不能简单地通过E_interaction = E_AB - E(A) - E(B)来计算，因为E_AB能...
过渡态、反应路径的计算方法及相关问题
Calculation methods of transition states and reaction paths and related issues
文/Sobereva @北京科音
First release: 2009-Aug-6 Last update: 2019-Feb-4
前言：本文主要介绍过渡态、反应路径的计算方法，并讨论相关问题。由于这类算法极多，可以互相组合，限于精力不可能面面俱到展开，...
计算化学相关的免费的在线数据库及工具
Free online databases and tools related to computational chemistry
文/Sobereva @北京科音
First release: 2009-Jul-11 Last Update: 2015-Dec-2
这些是我平时收集的和计算化学/分子模拟有关的免费的在线的库和工具，既在线又免费的实用的网站是很有价值的。其中有些对计算...
谈谈分子模拟中的隐式溶剂模型与GB模型
On the implicit solvation model and GB model in molecular simulation
文/Sobereva @北京科音 Last update: 2010-Apr-6
本文主要讨论分子模拟中隐式溶剂模型和GB模型（=Generalized Born，广义Born模型）的各个方面。
隐式水模型优势主要有下：
减少体系的粒子数从而降低计算开销。
没有溶剂摩擦效...