注:强烈建议读者先阅读笔者后来写的《使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图》(http://sobereva.com/445),其中将本文的操作过程通过脚本极大地简化,只需要不到1/20的时间就可以绘制出本文相同效果的图像。
Multiwfn结合VMD绘制AIM拓扑分析图
Drawing AIM topological analysis diagram by combinely using Multiwfn and VMD
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研究波函数分析的主要人物一览
List of known people in the field of wavefunction analysis
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Sep-28 Last update: 2023-Jul-19
很多人对波函数分析十分陌生,误以为是个极为小众向的领域,导致本人时常被问及当今研究波函数分析的主要人物都有哪些。实际上做波函数分析的...
通过键级曲线和ELF/LOL/RDG等值面动画研究化学反应过程
Studying chemical reaction process via curve map of bond order and anime of ELF/LOL/RDG isosurface
文/Sobereva @北京科音 2013-Sep-11
很久很久以前,寡人写过一篇帖子名为《制作动画分析电子结构特征》(http://sobereva.com/86)。在...
产生Gaussian的IRC和SCAN任务每个点的波函数文件的工具:IRCsplit和SCANsplit
IRCsplit and SCANsplit: Tools to generate wavefunction file for each point of IRC and SCAN tasks of Gaussian
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Sep-9 Last update: 2...
在VMD中显示原子序号的方法
The way of displaying atomic index in VMD
文/Sobereva@北京科音
First release: 2013-Jul-30 Last update: 2014-Jul-23
VMD虽然灵活强大,但是却没有提供一般的分子可视化软件的直接显示全部原子序号的功能,比较不方便。但是这也可以手动或者通过脚本来实现。
手动实现的办...
宇宙学模拟程序GADGET 2.0.7安装方法
Installation of the cosmology simulation program GADGET 2.0.7
文/Sobereva @北京科音 2013-Jul-25
GADGET-2 (GAlaxies with Dark matter and Gas intEracT)是一个极为流行的宇宙学模拟程序,地位大抵类似于量子化学中的Gaussian(貌似),原文见Mon...