2013年10月完结动画简评 文/Sobereva  2013-Oct-11 还是按照惯例，每隔一个季度简评一下笔者完整看过的刚完结的动画，此文包含27部作品。 最佳音乐奖：蔷薇少女 新作，宇宙战舰大和号2199 TV 优秀音乐奖：有你的小镇，空之境界TV 最佳女CV：橘田泉（黑木智子-丧女），花泽香菜（黑猫-俺妹2） 优秀女CV：竹达彩奈（沢渡楓-玉响2、桐乃-俺妹2），新井里美（黑子-超科学的电磁炮S），阿澄佳奈（...

注：本文仅是对VSCF的简略介绍，在北京科音高级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KAQC_content.html）中的“分子振动问题的高级计算方法”一节专门详细深入介绍VSCF、VMP2、VCI等方法的原理并给出GAMESS-US程序做这些计算的实际例子，推荐希望专门具体学习这些内容的读者参加 浅谈VSCF求解分子振动问题 Brief introduction to solving molecular v...

研究波函数分析的主要人物一览 List of known people in the field of wavefunction analysis 文/Sobereva @北京科音 First release: 2013-Sep-28   Last update: 2023-Jul-19 很多人对波函数分析十分陌生，误以为是个极为小众向的领域，导致本人时常被问及当今研究波函数分析的主要人物都有哪些。实际上做波函数分析的...

Multiwfn 2013年暑期培训班感想与杂谈 文/Sobereva   2013-Sep-17 在2013年8月13日至15日，在北京科技大学召开了第一届波函数分析暨Multiwfn培训班，此文就随便、没有条理地谈谈此次培训班的感想以及展望。 此次培训班全部所用的幻灯片，包括现场演示的一些动画可以在此处下载http://pan.baidu.com/share/link?shareid=759751855&uk=...

通过键级曲线和ELF/LOL/RDG等值面动画研究化学反应过程 Studying chemical reaction process via curve map of bond order and anime of ELF/LOL/RDG isosurface 文/Sobereva @北京科音  2013-Sep-11 很久很久以前，寡人写过一篇帖子名为《制作动画分析电子结构特征》（http://sobereva.com/86）。在...

产生Gaussian的IRC和SCAN任务每个点的波函数文件的工具：IRCsplit和SCANsplit IRCsplit and SCANsplit: Tools to generate wavefunction file for each point of IRC and SCAN tasks of Gaussian 文/Sobereva @北京科音 First release: 2013-Sep-9   Last update: 2...

在布达佩斯拍的一点照片 文/Sobereva  2013-Sep-3   去Budapest参加ISTCP-VIII (http://coulson.chem.elte.hu/istcp8/)，不是去玩，所以本来也没打算拍照。又嫌带着麻烦、行李箱放不下，就没带着NEX-5R。但是还是忍不住拿MI2拍了点儿景。没法指望手机能拍出什么好效果，凑合看吧。 话说ISTCP-VIII真是大牌云集，杨伟涛、Gill、Be...

在VMD中显示原子序号的方法 The way of displaying atomic index in VMD 文/Sobereva@北京科音 First release: 2013-Jul-30    Last update: 2014-Jul-23 VMD虽然灵活强大，但是却没有提供一般的分子可视化软件的直接显示全部原子序号的功能，比较不方便。但是这也可以手动或者通过脚本来实现。 手动实现的办...

注：笔者后来又写了《使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图》（http://sobereva.com/443），是绘制分子表面静电势图最完美的解决方案。其中通过脚本，把此文的绘制标准静电势填色的范德华表面图的步骤简化到了极致，只需要用不到本文1/10的步骤和耗时就可以达到比本文更好的效果，而且完全避免了用户对VMD操作不熟导致画不出来图。强烈建议读者先阅读443这篇文章后再读本文，两篇文章有互补性。 使用Mult...

宇宙学模拟程序GADGET 2.0.7安装方法 Installation of the cosmology simulation program GADGET 2.0.7 文/Sobereva @北京科音  2013-Jul-25 GADGET-2 (GAlaxies with Dark matter and Gas intEracT)是一个极为流行的宇宙学模拟程序，地位大抵类似于量子化学中的Gaussian（貌似），原文见Mon...

2013年7月完结动画简评 文/Sobereva  2013-Jul-4 季度颁奖： 最佳OP：革命机Valvrave，麻雀酒店，潜行吧！奈亚子W 优秀OP：悠悠式，DD北斗神拳，恶之华 最佳ED：革命机Valvrave，恶之华，潜行吧！奈亚子W 优秀ED：AIURA，打工吧！魔王大人，恶魔幸存者2 最佳女主角：仲村佐和（恶之华），奈亚子（潜行吧！奈亚子W） 优秀女主角：绫濑千早（花牌情缘2），斋枫（独眼巨人少女斋枫...

GAMESS-US的编译方法 Compilation method of GAMESS-US 文/Sobereva@北京科音 First release: 2013-Jul-3   Last update: 2024-Sep-26 本文介绍GAMESS-US程序的编译方法，版本是2024-R2 Patch 1，对于未来的版本可能适用也可能不适用，请随机应变。以下是笔者的编译环境。 CPU：双路AMD EPYC 7R32。此机子的介...

适合理论、计算化学投稿的期刊及其2012年影响因子（2013年公布） 文/Sobereva @北京科音  2013-Jun-20 2009年的影响因子见http://sobereva.com/64 2010年的影响因子见http://sobereva.com/92 2011年的影响因子见http://sobereva.com/149 文中期刊名称一般用标准缩写，括号里面是常用简称或者全名，之后是ISSN号。斜杠前是2012年的两年期影响因子（即一般所谓的影响因...

简谈NBO间的相对相位问题 On the relative phase between NBO orbitals 文/Sobereva @北京科音  2013-Jun-13 在思想家公社群里有人研究C2H5OC2H5自由基阳离子，问为何在6-31+G*和6-31++G**下得到的beta NBO中的氧的LP*与C-H的BD的相对相位发生了反转、这样情况下如何讨论轨道间相互作用。这个问题感觉还是值得专门谈一下的。 ...

谈谈分子半径的计算和分子形状的描述 On the calculation of molecular radius and description of molecular shape 文/Sobereva @北京科音 First release：2013-Jun-7   Last update：2019-Oct-21 经常有人谈及和分子形状有关的话题，本文就说说常用的三种模型怎么讨论和计算，即球形模型、圆柱模型...