注：笔者后来又写了《使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图》（http://sobereva.com/443），是绘制分子表面静电势图最完美的解决方案。其中通过脚本，把此文的绘制标准静电势填色的范德华表面图的步骤简化到了极致，只需要用不到本文1/10的步骤和耗时就可以达到比本文更好的效果，而且完全避免了用户对VMD操作不熟导致画不出来图。强烈建议读者先阅读443这篇文章后再读本文，两篇文章有互补性。 使用Mult...

宇宙学模拟程序GADGET 2.0.7安装方法 Installation of the cosmology simulation program GADGET 2.0.7 文/Sobereva @北京科音  2013-Jul-25 GADGET-2 (GAlaxies with Dark matter and Gas intEracT)是一个极为流行的宇宙学模拟程序，地位大抵类似于量子化学中的Gaussian（貌似），原文见Mon...

2013年7月完结动画简评 文/Sobereva  2013-Jul-4 季度颁奖： 最佳OP：革命机Valvrave，麻雀酒店，潜行吧！奈亚子W 优秀OP：悠悠式，DD北斗神拳，恶之华 最佳ED：革命机Valvrave，恶之华，潜行吧！奈亚子W 优秀ED：AIURA，打工吧！魔王大人，恶魔幸存者2 最佳女主角：仲村佐和（恶之华），奈亚子（潜行吧！奈亚子W） 优秀女主角：绫濑千早（花牌情缘2），斋枫（独眼巨人少女斋枫...

GAMESS-US的编译方法 Compilation method of GAMESS-US 文/Sobereva@北京科音 First release: 2013-Jul-3   Last update: 2024-Sep-26 本文介绍GAMESS-US程序的编译方法，版本是2024-R2 Patch 1，对于未来的版本可能适用也可能不适用，请随机应变。以下是笔者的编译环境。 CPU：双路AMD EPYC 7R32。此机子的介...

适合理论、计算化学投稿的期刊及其2012年影响因子（2013年公布） 文/Sobereva @北京科音  2013-Jun-20 2009年的影响因子见http://sobereva.com/64 2010年的影响因子见http://sobereva.com/92 2011年的影响因子见http://sobereva.com/149 文中期刊名称一般用标准缩写，括号里面是常用简称或者全名，之后是ISSN号。斜杠前是2012年的两年期影响因子（即一般所谓的影响因...

简谈NBO间的相对相位问题 On the relative phase between NBO orbitals 文/Sobereva @北京科音  2013-Jun-13 在思想家公社群里有人研究C2H5OC2H5自由基阳离子，问为何在6-31+G*和6-31++G**下得到的beta NBO中的氧的LP*与C-H的BD的相对相位发生了反转、这样情况下如何讨论轨道间相互作用。这个问题感觉还是值得专门谈一下的。 ...

谈谈分子半径的计算和分子形状的描述 On the calculation of molecular radius and description of molecular shape 文/Sobereva @北京科音 First release：2013-Jun-7   Last update：2019-Oct-21 经常有人谈及和分子形状有关的话题，本文就说说常用的三种模型怎么讨论和计算，即球形模型、圆柱模型...

ComicDive8同人展收获和杂谈 文/Sobereva(3)  2013-Jun-8 ComicDive8于2013年5月19日在国家会议中心举办。 这次排的队出奇的长。CD7的时候基本没排队就进去了，而CD5、CD6，排队时间我记得也没超过半个小时。这回明明已经事先买了票，到了那里是10:00AM，刚开场的时间，没想到居然排了两个小时的队才进去。队伍的长度，在通道内都已经折返成了三排，然后都绕到国家会议中心...

赝势的函数形式以及在量子化学程序中定义的方式 The function form of pseudopotential and how it is defined in quantum chemistry programs 文/Sobereva @北京科音  2013-May-29 1 前言 赝势在量子化学计算中使用得极为普遍，有时需要用的赝势在量子化学程序中没有内置，就得通过自定义的方式添加，例如Stuttgart赝势对于...

C83音乐推荐 文/Sobereva  2013-May-21   C83音乐整体水准超过前几届，特别是非东方project的部分。这次的音乐推荐是总共从103张几乎所有网上能找到的C83的CD中十分严格地精选出来的。由于撰文时C83已过去了很久，所以应该不会有漏网之鱼。依然和以前的音乐推荐一样，是否列入推荐列表只看音乐本身的素质，除此以外一切因素皆不考虑。 非东方Project部分中最佳部分共50首，不错的...

后记：针对aNCI方法用于蛋白质-配体相互作用的分析，笔者后来专门写了一篇文章《使用Multiwfn做aNCI分析图形化考察动态过程中的蛋白-配体间的相互作用》（http://sobereva.com/591）。本文的读者千万别忘了看此文！ 使用Multiwfn研究分子动力学中的弱相互作用 Using Multiwfn to study weak interaction in molecular dynamics 文/Sobereva @北...

全部歌曲的录像合集见此：http://www.youku.com/playlist_show/id_19190324.html。本文文末有每首歌曲单独的链接。 AM三周年纪念LIVE杂谈、照片和演出录像 文/Sobereva(3)  2013-Apr-30 2013年4月21日1:00PM~6:00PM的ANIMANIA在MAO LIVE HOUSE的Live演出是ANIMANIA成立三周年的纪念演出，挺有特别意义的。这也是寡...

注：此文已经很长很长时间没有更新，我也没有精力更新，内容大多都已经过时。请参看不断更新的《Multiwfn FAQ》（http://sobereva.com/452）和《Multiwfn入门tips》（http://sobereva.com/167）。截止到2024年8月版Multiwfn的最最最全面、最最最系统的介绍文章见《Multiwfn波函数分析程序的最新最全面的介绍文章已在JCP上发表！》（http://sobereva.com/726），强烈建议阅读！ ...

PED分析软件VEDA4简介 A brief introduction to PED analysis program VEDA4 文/Sobereva @北京科音   2013-Apr-15 PED分析工具有很多。笔者曾经介绍过GAR2PED，见《Potential energy distribution(PED)计算软件GAR2PED使用简介》（http://sobereva.com/75），但是程序使用起来...

利用wfn文件计算电子密度的代码的编写方法 How to write code to calculate electron density using wfn files 文/Sobereva @北京科音   2013-Apr-11 在《杂谈Multiwfn从1.0到3.0版的开发经历》（http://sobereva.com/180）一文中曾经提到过，寡人三年多以前开发Multiwfn最初的动机是为了写个帖子介绍怎么通过...