注:笔者后来开发了genmixmem,可以实现genmem的所有功能,还能生成混合膜,因此genmem已没有存在意义了。见《生成混合组分的磷脂双层膜结构文件的工具genmixmem》(http://sobereva.com/245)
生成磷脂双层膜结构文件的小工具genmem
genmem: A small tool that generates phospholipid bilayer membrane structure files
文/Sober...
谈谈谐振频率校正因子
Introduction to the scale factor of harmonic frequencies
文/Sobereva @北京科音
First release: 2014-Jan-19 Last update: 2020-Aug-4
前言:本文对量子化学计算振动问题涉及的频率校正因子的概念做简要的介绍,这是改进谐振近似下算的振动光谱的常用做法,对于改进ZPE的计算精度也有宜。详细...
一些波函数分析词汇的中文翻译
Chinese translation of some wavefunction analysis vocabulary
文/Sobereva@北京科音
First release: 2014-Jan-16 Last update: 2026-Jan-31
由于波函数分析方面目前没有中文的专著,很多波函数分析方法甚至从未在中文文献中出现过,导致有些人在写中文论文时遇到困难,不知道怎么翻译波函数分析当中的词汇。...
PM7、PM6-DH+半经验方法在优化碱基对儿时的失败
Failure of PM7 and PM6-DH+ semi-empirical methods in optimizing base pairs
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Dec-30 Last update: 2015-Jul-18
已在《大体系弱相互作用计算的解决之道》(http://sobereva.com/214)...
LACVP这类方式命名的基组的含义
The meaning of basis sets named in such a way as LACVP
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Nov-16 Last update: 2018-Oct-17
这类基组的命名是来自Jaguar程序,详见Jaguar手册。它们都是混合基组,对轻原子用全电子基...
mopac2xyz:将MOPAC的几何优化过程转换为xyz轨迹文件的工具
mopac2xyz: A tool to convert geometry optimization process of MOPAC program into xyz trajectory file
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Nov-12 Last update: 2021-Sep-20
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DFT交换相关泛函库的使用方法
The use of DFT exchange-correlation functional libraries
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Nov-10 Last update: 2019-Feb-10
1 前言
DFT大行其道的今天,写量子化学程序总是免不了要涉及DFT计算,而DFT的核心就是交换相关...
注:本文主要讲DFT-D3。笔者后来又写了文章专门介绍DFT-D4,见《DFT-D4色散校正的简介与使用》(http://sobereva.com/464)。
DFT-D色散校正的使用
Use of DFT-D dispersion correction
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Nov-7 Last update: 2024-Apr-8
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