谈谈有小虚频时热力学量的计算
On the calculation of thermodynamic quantities when there are small imaginary frequencies
文/Sobereva@北京科音 2024-Feb-9
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量子化学研究中在优化完极小点结构然后做振动分析时遇到虚频是家常便饭的烦人的问题。之前我专门写过博文《Gaussian中几何优化收敛后Freq时...
谈谈如何计算环张力能:以CPP和碳单环体系为例
On the calculation of ring strain energy: Taking CPP and cyclocarbon systems as examples
文/Sobereva@北京科音 2024-Jan-29
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环状化学体系具有不同程度的环张力,环张力和环状体系的诸多问题紧密相关,诸如生成焓、稳定性、合成难易程度等。环张力...
使用Multiwfn基于Hirshfeld-I划分计算特定类型电子在各个原子上的分布量
Using Multiwfn to calculate the distribution of specific types of electrons on each atom based on Hirshfeld-I partitioning
文/Sobereva@北京科音 2024-Jan-26
在《18碳环等电子体B6N6C6独特的芳...
18碳环等电子体B6N6C6独特的芳香性:揭示碳原子桥联硼-氮对电子离域的关键影响
The unique aromaticity of isoelectronic molecule of cyclo[18]carbon, B6N6C6: Revealing the key role of the carbon atom bridging boron and nitrogen on electron delocalization
文/Sobereva@北...
使用Dalton通过CC3方法极高精度计算激发态
Extremely high-precision calculation of excited states using the CC3 method in Dalton program
文/Sobereva@北京科音 2023-Dec-30
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耦合簇方法可以通过线性响应(linear response, LR)计算激发态。在常见范畴内,精度和耗...
几种基于核酸序列构建三维结构的工具
Several tools for constructing three-dimensional structures based on nucleic acid sequences
文/Sobereva@北京科音 2023-Dec-20
之前我在《几种基于氨基酸序列构建很简单蛋白质三维结构的工具》(http://sobereva.com/687)中介绍过一些基于氨基酸序列构建简...
CP2K做杂化泛函计算的关键要点和简单例子
Key points and simple examples of hybrid functional calculations with CP2K
文/Sobereva@北京科音
First release: 2023-Nov-7 Last update: 2024-Mar-9
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对周期性体系,杂化泛函的计算耗时众所周知远...
Multiwfn在Linux下安装的中文说明
Chinese instructions for installing Multiwfn under Linux
文/Sobereva@北京科音 2023-Oct-22
非常流行的波函数分析程序Multiwfn(http://sobereva.com/multiwfn)在Linux下的安装方法在Multiwfn手册2.1.2节有充分的说明,但我发现老有人不仔细看,或者...
几种基于氨基酸序列构建很简单蛋白质三维结构的工具
Several tools for constructing three-dimensional structures of very simple proteins based on amino acid sequences
文/Sobereva@北京科音 2023-Oct-15
经常有人问已知很简单蛋白质(小肽)的氨基酸序列,怎么得到其三维立体结构,这里就介绍几...
使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
Using sobEDA and sobEDAw methods to perform very accurate, fast, convenient and universal energy decomposition analysis
文/Sobereva@北京科音
First release: 2023-Aug-31 ...