计算化学购机配置推荐 Recommendation on purchasing computers for computational chemistry 文/Sobereva @北京科音 Last update: 2025-Apr-25 1 重要前言 经常有人问买机子做计算化学计算该用什么配置，这要根据预算、主要用的程序、主要做的任务类型、算的体系大小、对购买渠道有无限制等很多因素综合考虑。这里，笔者根据不同...

这个是截止到2018年10月2日，第2002~3001篇使用了Multiwfn程序发表的文章的全文pdf合集，下载地址：https://pan.baidu.com/s/1DuFJQxax1MxTxO9MQjLBaQ 这是此文件包里所有文件的列表http://sobereva.com/attach/438/list.txt 由于本文件包里绝大部分文章都是它们刚在期刊网站上作为ASAP刊登的时候我就下载的，所以文档中大多没有页码、卷号，大家只要到google学术搜索里...

2023-Sep-1注：如果你的目的是对片段间相互作用能进行分解，并不关注各个原子的贡献，且体系也不是特别巨大，那么强烈建议用笔者在2023年提出的sobEDA和sobEDAw能量分解，其精度、普适性都远强于本文介绍的EDA-FF，用起来还更简单，是片段间能量分解的完美解决方案。介绍见《使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析》（http://sobereva.com/685）。 使用Multiwfn做基于分子力场的...

补充1：后来又写了《计算RESP原子电荷的超级懒人脚本》（http://sobereva.com/476），脚本会自动调用Gaussian和Multiwfn完成所有需要的计算，使得RESP电荷计算过程惊人的简单，从初始结构文件到给出最终RESP电荷，仅仅一行命令就能实现！ 补充2：笔者后来写了《RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算》（http://sobereva.com/531），其中介绍的RESP2电荷是RESP的扩展，更恰当地考虑了溶剂对溶质电...

基于OpenBabel批量产生特定基团以任意方式接到苯上的结构的方法 A method to batch generate structures in which specific groups are attached to benzene in arbitrary way based on OpenBabel 文/Sobereva@北京科音  2018-Sep-6 1 前言 最近在计算化学公社论坛有人问（htt...

注：笔者在写这篇文章的时候，已经尽本人最大努力考虑到最初级的计算化学工作者理解能力的最底线，请睁大眼睛万分仔细一个字一个字过脑子地阅读本文5遍以上，只要理解能力正常的人100%能装上！如果还装不上，那么友情建议你及早改行成和计算模拟完全无关的领域，肯定能获得比搞计算化学更大的成果（也不要指望看网上其它文章就能装上，因为本文已经是网上关于装Gaussian的文章当中最详细的了）。   Gaussian的安装方法及运行时的相关问题 I...

2022-Mar-1注：本文介绍的功能已支持结合CP2K做TDDFT计算研究周期性体系的电子激发，参见《使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和考察电子激发态》（http://sobereva.com/634）。 使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征 Using Multiwfn to perform hole-electron analysis to fully investigate elect...

后记1：在本文介绍的IFCT分析思想的基础上，笔者又提出了电荷转移光谱（charge-transfer spectrum, CTS）的概念，可以从电荷转移角度将总的UV-Vis光谱进行分解分析，从而洞悉光谱的内在本质，见《使用Multiwfn绘制电荷转移光谱(CTS)直观分析电子光谱内在特征》（http://sobereva.com/628）。非常建议本文读者之后阅读。 后记2：从2022-Mar-15更新的Multiwfn版本开始，在IFCT分析输出中会直接给出电荷...

注1：2020-Jul-4及以后版本的Multiwfn的自身的静电势代码计算速度较之前版本有脱胎换骨般提升，见《Multiwfn的计算静电势的内部代码速度得到了极大的提升！》（http://bbs.keinsci.com/thread-18268-1-1.html）、《Multiwfn使用的高效的静电势算法的介绍文章已于PCCP期刊发表！》（http://sobereva.com/614）。对于计算拟合静电势电荷、分子表面静电势的定量分析强烈不建议按照此文这样调用cubegen，...

重要提示：本文介绍的方法笔者已经发表于Theor. Chem. Acc., 139, 25 (2020) DOI: 10.1007/s00214-019-2541-z，其中专门对pi电子结构分析的算法和应用做了详细、深入的介绍和讨论，给了许多应用例子，本文读者看完后务必看一下这篇文章。使用本文提到的Multiwfn的功能的读者，除了必须引用Multiwfn的原文以外，也务必同时引用上述文章。 2021-Sep-25注：笔者后来在Chemistry—Methods, ...

通过SMD溶剂模型描述离子液体溶剂环境的方法 The method to describe solvent environment of ionic liquid via SMD solvation model 文/Sobereva @北京科音  2018-Aug-7 离子液体已被广泛作为溶剂。常有人问离子液体溶剂环境怎么在量子化学计算中体现，本文就专门说一下。阅读本文之前务必先阅读《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计...

2018年7月完结动画简评 文/Sobereva  2018-Aug-1 本文是笔者完整观看过的2018年7月完结的25部全长TV版动画和6部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份，怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话，没追的要么是笔者对其题材有抗拒（比如恐怖或者胡搞类），要么就是制作质量太差、太低俗、太粗野、内容太老套、太平庸、太莫名其妙等作品自身问题。 全长番一般评分区间是90~95分（低于90分根本不追，超过95...

使用Multiwfn计算激发态之间的密度差 Using Multiwfn to calculation electron density difference between excited states 文/Sobereva @北京科音 First release: 2018-Jul-28   Last update: 2022-Jul-14 1 前言 使用Multiwfn计算密度差、绘制各...

2018年上半年优秀动画音乐推荐 文/Sobereva  2018-Jul-7 这是第8次写“优秀动画音乐推荐”系列文章，此系列从2014年起不断发布，致力于尽自己微薄之力，令最杰出、最美妙的音乐能有出头之地，而不被数目是它们20倍以上的海量的平庸、凑数的音乐埋没。之前的动画音乐推荐见 《2017年下半年优秀动画音乐推荐》（http://sobereva.com/405） 《2017年上半年优秀动画音乐推荐》（http://sobereva...

适合理论、计算化学投稿的期刊及其2017年影响因子（2018年公布） 文/Sobereva @北京科音  2018-Jun-30 未经授权，严禁转载 此文对适合理论、计算化学投稿的期刊进行罗列，并附上2018年6月公布的2017年影响因子(IF)。 文中期刊名称一般用标准缩写，括号里面是常用首字母简称或者全名，之后是ISSN号。斜杠前是2017年的两年期影响因子（即一般所谓的影响因子），斜杠后是撰此文时的最新中科院分区。有些新...