为什么我极度鄙视和厌恶百毒

为什么我极度鄙视和厌恶百毒 Why do I despise and hate Baidu so much? 文/Sobereva  First release: 2018-Dec-3  Last update: 2020-Oct-25 我对百毒的鄙视和厌恶由来已久,早就想写此文,但一直没空。正好昨天有个人在我的一个两千多人的专业的科研群里大肆鼓吹使用百毒、百毒学术、百毒文库,结果被笔者和群友一通批判。我...

Multiwfn支持的电子激发分析方法一览

Multiwfn支持的电子激发分析方法一览 An overview of electron excitation analysis methods supported by Multiwfn 文/Sobereva@北京科音 First release: 2018-Nov-14  Last update: 2022-Mar-1 0 前言 电子激发的研究是量子化学最重要的研究领域之一。波函数分析程...

使用Multiwfn+VMD快速绘制高质量分子轨道等值面图(含视频)

注1:本文有完整的演示视频,初学者严格照着操作!5分钟内不可能学不会!https://www.bilibili.com/video/av34024335/ (别说字太小看不清楚,登录后看1080p的,不可能看不清楚) 注2:在本文的基础上,通过修改材质和恰当使用Tachyon渲染器,可以得到效果远胜于本文的轨道等值面图,务必在看过本文后一看:《用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法(含演示视频)》(http://sobereva.com/449) 使用Mu...

2018年10月完结动画简评

2018年10月完结动画简评 文/Sobereva  2018-Oct-16 本文是笔者完整观看过的2018年10月完结的24部全长TV版动画和5部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份,怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话(扫番过程的粗略观感在http://bbs.keinsci.com/forum-68-1.html里的相应帖子里写了),没追的要么是笔者对其题材有抗拒(比如恐怖或者胡搞类),要么...

使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)

注:本文有对应的演示视频,必看!见https://www.bilibili.com/video/av33733749/ 凡是按照本文的详细说明还绘制不出来的人,一定要精确严格重复视频里的操作!应先把视频里的示例体系重复一遍,连这个例子都重复不出来者注意看本文文末的文字 使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图 Using Multiwfn+VMD to rapidly plot elec...

计算化学购机配置推荐

计算化学购机配置推荐 Recommendation on purchasing computers for computational chemistry 文/Sobereva @北京科音 Last update: 2024-Mar-6 1 重要前言 经常有人问买机子做计算化学计算该用什么配置,这要根据预算、主要用的程序、主要做的任务类型、算的体系大小、对购买渠道有无限制等很多因素综合考虑。这里,笔者根据不同预算...

使用了Multiwfn发表的第2002~3000篇文章打包下载

这个是截止到2018年10月2日,第2002~3001篇使用了Multiwfn程序发表的文章的全文pdf合集,下载地址:https://pan.baidu.com/s/1DuFJQxax1MxTxO9MQjLBaQ 这是此文件包里所有文件的列表http://sobereva.com/attach/438/list.txt 由于本文件包里绝大部分文章都是它们刚在期刊网站上作为ASAP刊登的时候我就下载的,所以文档中大多没有页码、卷号,大家只要到google学术搜索里...

使用Multiwfn做基于分子力场的能量分解分析

2023-Sep-1注:如果你的目的是对片段间相互作用能进行分解,并不关注各个原子的贡献,且体系也不是特别巨大,那么强烈建议用笔者在2023年提出的sobEDA和sobEDAw能量分解,其精度、普适性都远强于本文介绍的EDA-FF,用起来还更简单,是片段间能量分解的完美解决方案。介绍见《使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析》(http://sobereva.com/685)。 使用Multiwfn做基于分子力场的...

RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算

补充1:后来又写了《计算RESP原子电荷的超级懒人脚本》(http://sobereva.com/476),脚本会自动调用Gaussian和Multiwfn完成所有需要的计算,使得RESP电荷计算过程惊人的简单,从初始结构文件到给出最终RESP电荷,仅仅一行命令就能实现! 补充2:笔者后来写了《RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算》(http://sobereva.com/531),其中介绍的RESP2电荷是RESP的扩展,更恰当地考虑了溶剂对溶质电...

Gaussian的安装方法及运行时的相关问题

注:笔者在写这篇文章的时候,已经尽本人最大努力考虑到最初级的计算化学工作者理解能力的最底线,请睁大眼睛万分仔细一个字一个字过脑子地阅读本文5遍以上,只要理解能力正常的人100%能装上!如果还装不上,那么友情建议你及早改行成和计算模拟完全无关的领域,肯定能获得比搞计算化学更大的成果(也不要指望看网上其它文章就能装上,因为本文已经是网上关于装Gaussian的文章当中最详细的了)。   Gaussian的安装方法及运行时的相关问题 I...