在VMD中计算RMSD衡量两个结构间的几何偏差

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在VMD中计算RMSD衡量两个结构间的差异以及叠合两个结构 Calculating RMSD in VMD to measure the difference between two structures and to superimpose two structures 文/Sobereva@北京科音 First release: 2015-May-11  Last update: 2020-Feb-25 1 原理 RMSD...

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图解电子激发的分类

图解电子激发的分类 Illustration of classification of electronic excitations 文/Sobereva @北京科音 First release: 2015-Mar-9  Last update: 2018-Sep-8   电子垂直激发涉及许多类型。经常有人问怎么判断电荷转移激发，怎么指认激发类型等等，这个帖子就通过实例和图形进行介绍。 1 概述...

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不同DFT泛函的HF成份一览 List of HF composition of different DFT functionals 文/Sobereva @北京科音 First release: 2015-Feb-23   Last update: 2022-May-7 这里把常见的杂化泛函的HF交换成份从低到高进行排序列出。一些类型的计算直接依赖于HF成份，因此有这么个列表是比较有用的。比如，众所周知...

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2014年下半年优秀动画音乐推荐

2014年下半年优秀动画音乐推荐 文/Sobereva(2)    2015-Jan-18   这是第2次写“优秀动画音乐推荐”系列文章，此系列从2014年起每半年发一次。第一次见《2014年上半年优秀动画音乐推荐》（http://sobereva.com/244）。不管动画是否追了，所有新番的OST、OP/ED、歌曲集、角色集什么的一切衍生的音乐相关的产物笔者都是一个不落全仔细听完的，平均每天听3~4张，并...
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