2020-Sep-14后记：本文中关于多中心键级计算耗时的说法已经完全过时了。因为从2020-Sep-12更新的Multiwfn开始，程序中实现了笔者提出的一种超快的多中心键级计算算法，而精度没有丝毫损失，对于哪怕含有几十个原子的环也可以非常快速地计算多中心键级，这使得多中心键级的应用范畴有了革命性的扩展。相比之下，AV1245的实际价值就已经不大了。
使用Multiwfn计算AV1245指数研究大环的芳香性
Using Multiwfn ...
谈谈如何衡量分子的极性
The way of measuring molecular polarity
文/Sobereva@北京科音
First release: 2019-Oct-16 Last update: 2020-Sep-29
0 前言
经常有人问怎么衡量分子的极性，是不是算个偶极矩就可以。实际上，极性是一个非常含糊的概念。从本质上来说，极性来自于净电荷分布的不均匀性，不均匀性越大则极性越...
将Gaussian等程序收敛的波函数作为ORCA的初猜波函数的方法
The method of using the converged wavefunction of Gaussian or other program as the initial guess wavefunction of ORCA
文/Sobereva@北京科音
First release: 2019-Oct-11 Last update: 2021-Oc...
关于为什么Multiwfn算的出RESP电荷与Antechamber的有所差异
Regarding why the RESP charge calculated by Multiwfn is different from that of Antechamber
文/Sobereva@北京科音 2019-Sep-27
0 前言
RESP电荷的原理、细节以及计算在《RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算》（ht...
注：笔者后来又写了《使用Multiwfn通过局部电子附着能(LEAE)考察亲核反应位点、难易及弱相互作用》（http://sobereva.com/676），其中介绍的重要的LEAE函数与ALIE有关键性的互补，非常推荐阅读！
使用Multiwfn和VMD绘制平均局部离子化能(ALIE)着色的分子表面图（含视频演示）
Using Multiwfn and VMD to plot map of molecular surface colore...
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
Thoroughly understanding the nature of hydrogen bonds and estimating hydrogen bond strength easily and reliably: An introduction to an important research article published in JCC in the 2019
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使用Multiwfn对第一超极化率做双能级和三能级模型分析
Using Multiwfn to perform two-level and three-level model analyses for first hyperpolarizability
文/Sobereva@北京科音
First release: 2019-Sep-6 Last update: 2025-Jun-10
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谈谈怎么正确认识论文投稿时对图像分辨率的要求
On the correctly understanding the requirements for image resolution when submitting a paper
文/Sobereva@北京科音 2019-Aug-31
笔者在思想家公社QQ群和计算化学公社论坛交流、答疑时，时常看到有人提到有关图片的分辨率的问题，一些期刊在投稿时对分辨率有明确要求。...
利用photoshop计算晶体表面孔洞面积
Using photoshop to calculate hole area on crystal surface
文/Sobereva@北京科音 2019-Aug-31
今天思想家公社QQ群里有人发了一张图片，问文献中标注的MoS2的孔洞面积是怎么算的
其实用photoshop就可以实现计算。拿上图右下角那个体系为例，我们实际上要统计的就是图...
给def2以ma-方式加弥散函数的Gaussian格式的基组定义文件（含所有def2支持的元素）
Basis set definition file in Gaussian format that adds diffuse functions to def2 series in the way of "ma-" (including all elements supported by def2)
文/Sobereva@北京科音
First ...
为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序
First release: 2019-Aug-26 Last update: 2023-Dec-21
提示：此文对D摩3的讨论仅限于D摩3算孤立体系（分子、团簇），D摩3算周期性体系的情况不属于本文的讨论范畴。但即便算周期性体系也是我很不推荐用D摩3的，速度远慢于免费且功能更强大、更灵活的CP2K，而且CP2K的使用并不困难，通过北京科音CP2K第一性原...
后记：此文用VMD的做法已经没有意义了，用Multiwfn来实现方便得多！仔细看《Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍》（http://sobereva.com/610）中的介绍，特别是2.6节的例子。
让体系(跃迁)偶极矩平行于某个笛卡尔轴的方法
Method to make (transition) dipole moment of a system parallel to a certain Cartesian ax...
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生
On the judgement whether a reaction is easy to occur based on potential barrier
文/Sobereva@北京科音
First release: 2019-Aug-23 Last update: 2024-Dec-31
经常有人问“反应势垒小于多少反应才容易发生？”这种问题，本文就专门说一下。
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