使用Sobtop超级方便地创建二茂铁的GROMACS的拓扑文件 Using Sobtop to create GROMACS topology file for ferrocene super conveniently 文/Sobereva@北京科音   2022-Feb-17 0 前言 Sobtop是笔者开发的主要用于产生各种类型体系的GROMACS拓扑文件的程序，可以在主页http://soberev...

2021年度完结动画总评 文/Sobereva  2022-Jan-24 此文对笔者完整看过的2021年度完结的91部全长版TV动画和13部泡面番进行总评，共约21万多字。剧场版、OVA之类的都没有纳入其中，因为另有文章。此文只有“2022年1月完结”部分是新写的，2021年4月、7月、10月完结的动画的评论在作品刚完结之时就已经写好并发在了笔者的blog上，在此文只是汇总而已（所以有些文字现在看起来已经out了），不过很多作品的总评分为了...

谈谈分子动力学模拟蛋白-配体复合物过程中配体发生脱离的原因 On the reasons why ligand detaches during molecular dynamics simulation of protein-ligand complex 文/Sobereva@北京科音   2022-Jan-13 有不少人问怎么他做基于经典力场的蛋白质-配体复合物的分子动力学模拟的过程中配体跑出去了。鉴于这个问题被问得...

2021年10月完结动画简评 文/Sobereva  2022-Jan-5 本文是笔者完整观看过的2021年10月完结的17部全长TV版动画和1部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份，怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话（扫番过程的粗略观感在http://bbs.keinsci.com/thread-23924-1-1.html里写了），没追的要么是笔者对其题材有抗拒（比如恐怖或者过于低幼），要么...

理论设计由18碳环与锂原子构成的电场可控的光学开关 Theoretical design of an electric field controllable optical switch composed of cyclo[18]carbon and a lithium atom 文/Sobereva@北京科音  2022-Jan-2 1 前言 18碳环（cyclo[18]carbon）自从2019年在凝聚相中被实验...

2021年下半年观看的非TV版动画简评 文/Sobereva  2022-Jan-1 这里对我从2021年7月1日开始截止到2021年12月31日观看的非TV版动画进行简单评论。由于这类动画不好对比和打分，我也就不给出评分了。以往的此系列文章和TV版动画评论见http://sobereva.com右方的“动画评论”分类。 妄想学生会2 剧场版 长度：约80min 妄想学生会系列老是隔三差五就出个OVA，不知道这个企划要延续多久...

使用Multiwfn绘制电荷转移光谱(CTS)直观分析电子光谱内在特征 Using Multiwfn to plot charge transfer spectrum (CTS) to intuitively analyze intrinsic characteristics of electronic spectrum 文/Sobereva@北京科音 First release: 2021-Dec-31  Last update...

谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡 On the judgement whether molecular dynamics simulation has reached equilibrium 文/Sobereva@北京科音  2021-Dec-24 0 前言 时常有人在思想家公社QQ群里或计算化学公社论坛（http://bbs.keinsci.com）里问关于怎么判断分子动力学模拟中体系是否达到平衡的问题，...

谈谈质子转移、氢原子转移、氢负离子转移的关系 On the relationship between proton transfer, hydrogen atom transfer, and hydrogen anion transfer 文/Sobereva@北京科音 First release: 2021-Dec-23  Last update: 2022-Jul-29 0 前言 质子转移、氢转移、...

令Gaussian 16中SCF未收敛到默认收敛限也能继续做后续计算的方法 A method to enable subsequent calculations to continue even if SCF in Gaussian 16 does not converge to the default convergence limit 文/Sobereva@北京科音  2021-Nov-17 注：本文内容对目前我用...

在VMD程序里对不同元素的原子用不同颜色显示的方法 The way to display atoms of different elements in different colors in VMD program 文/Sobereva@北京科音 First release: 2021-Nov-11  Last update: 2022-Sep-16 1 前言 之前笔者写了大量的将Multiwfn与VM...

revTPSS泛函结合pcSseg-1基组是计算NMR很好的选择 The revTPSS functional combined with the pcSseg-1 basis set is a good choice for NMR calculations 文/Sobereva@北京科音  2021-Oct-24 1 前言 计算NMR化学位移是量子化学常见而且重要的应用之一，之前笔者也写过一篇文章《谈谈如何又好...

谈谈第一超极化率(beta)的符号的物理意义 On the physical meaning of the sign of the first hyperpolarizability (beta) 文/Sobereve@北京科音    2021-Oct-22 1 前言 在《理论设计由18碳环与锂原子构成的电场可控的光学开关》（http://sobereva.com/630）里介绍的笔者的Carb...

在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚 When asking for help with computational chemistry problems online, one must describe the problem in detail, specificity, accuracy, and clarity 文/Sobereva@北京科音 First release: 2021-Oct-18&n...

截止到2021年9月28日，使用了Multiwfn波函数分析程序（http://sobereva.com/multiwfn）发表的文章已超过8000篇，用户已遍及世界近80个国家。下面是第7001~8000篇使用了Multiwfn程序发表的文章的全文pdf合集（其中漏了几篇文章对应的文件，不好找了。还有个别的没下载权限，用本文本文档代替了）。 百度网盘下载地址（速度慢）：链接：https://pan.baidu.com/s/1lS5pEDp8SN4YGmyOhKdac...