谈谈ORCA 5.0的新特性和改变
On the new features and changes of ORCA 5.0
文/Sobereva@北京科音
First release: 2021-Jul-2 Last update: 2021-Jul-10
1 前言
2021年7月1日,量子化学程序ORCA 5.0发布了,造成了不小影响。这个程序现在流行度已经相当高,从《2021年计算化学公社论坛“...
巨幅降低Multiwfn结合VMD绘制分子表面静电势图耗时的一个关键技巧
A key skill that greatly reduces the time-consuming of using Multiwfn combined with VMD to draw molecular surface electrostatic potential maps
文/Sobereva@北京科音 2021-Jun-30
1 前言
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Multiwfn可以计算的分子描述符一览
List of molecular descriptors that Multiwfn can calculate
文/Sobereva@北京科音
First release: 2021-Jun-22 Last update: 2024-Apr-17
0 前言
做QSAR(定量结构活性关系)和QSPR(定量结构属性关系)需要提供分子的描述符(molecula...
使用Multiwfn计算分子中的原子极化率
Calculating atomic polarizabilities in molecules using Multiwfn
文/Sobereva@北京科音
First release: 2021-Jun-4 Last update: 2024-Apr-25
1 前言
原子在孤立状态下的极化率是可以实验测量的,也很容易理论计算,在...
使用IRI方法图形化考察化学体系中的化学键和弱相互作用
Using IRI method to graphically study chemical bonds and weak interactions in chemical systems
文/Sobereva@北京科音
First release: 2021-May-31 Last update: 2024-Mar-29
1 前言
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要善用簇模型,不要盲目用ONIOM算蛋白质-小分子相互作用问题
Make good use of cluster models and do not blindly use ONIOM to study protein-small molecule interaction problems
文/Sobereva@北京科音 2021-May-22
初学者乱用、滥用Morokuma当年提出的ONIOM方法是一个长久以来就有的问题...
PS:此文介绍的工具主要是给一个外国合作者写的,所以文章写成了英文。
对Gaussian计算的IRC轨迹上每个点用PSI4做SAPT分析的辅助工具
A tool for performing SAPT analysis via PSI4 for each point on the IRC trajectory calculated by Gaussian
Sobereva@北京科音 2021-May-10
1 Preface
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利用Gaussian或ORCA程序把分子结构拉直的几种方法
Several methods to straighten molecular structures using Gaussian or ORCA program
文/Sobereva@北京科音
First release: 2021-May-4 Last update: 2021-Jun-15
1 前言
有人问怎么把...
比SMD算溶解自由能更好的溶剂模型uESE的使用
Use of uESE, a solvent model that is better than SMD for calculating solvation free energy
文/Sobereva@北京科音 2021-Apr-30
1 uESE溶剂模型简介
SMD是如今非常常用的溶剂模型,在《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》(http://soberev...
使用Multiwfn做aNCI分析图形化考察动态过程中的蛋白-配体间的相互作用
Using Multiwfn to perform aNCI analysis to graphically study protein-ligand interactions in dynamic process
文/Sobereva@北京科音
First release: 2021-Mar-4 Last update: 2022-Fe...