molpro2010的编译方法

molpro2010的编译方法

文/Sobereva(2)  2015-Oct-23



Intel i7-2630QM CPU,RHEL6U1 64bit系统,root用户。安装到/sob/molpro2010.1下。MKL库是以前安装Intel fortran & C compiler 12.1.0时的包里面带的(但这个不是必须的)。本想用ifort+icc编译,结果运行不正常(可能intel编译器版本太新),于是本文用系统自带的gcc+gfortran编译。

本文提供的是最简单的编译方法,步骤最大程度精简。

本文使用的源码的下载链接:http://pan.baidu.com/s/1dDe5Vep 密码:lgo3


============= 并行版本的编译 =============

解压molpro2010.1包,产生/sob/molpro2010.1目录,进入此目录,运行
./configure -mpp -auto-openmpi -gcc -gfortran
会看到提示已经识别了编译器以及MKL库。所有的提示都按回车用默认(安装目标的路径依实际情况输入)。程序会自动下载openmpi-1.4.3到/root/.molpro/cache/openmpi-1.4.3.tar.gz,并自动解压、进行编译,产生到src/openmpi-install目录。(如果机子没联网,可以自行获取openmpi压缩包并放到那个目录,程序会直接自动使用)

开始编译:
make -j
大约8分钟编译完毕。如果编译完毕后提示输入username,直接Ctrl+C中断掉。(如果需要在其它选项下重新编译,可以先用make veryclean清掉编译生成的文件,然后再重做以上步骤)

把license文件token改为.token放到/sob/molpro2010.1/lib目录下

然后然后进行测试:
make MOLPRO_OPTIONS=-n4 quicktest
代表用4核进行快速测试。几分钟,所有测试悉数通过。全面测试需要用把quicktest改为test。

在自己目录下的.bashrc中加入
export PATH=$PATH:/sob/molpro2010.1/bin
再把默认运行参数设定为环境变量,比如以下设定让运行时自动用四核、不自动备份同名老文件、运行后不生成.xml文件、分配6400MB内存:
export MOLPRO_OPTIONS="-n 4 -s --no-xml-output -m 800m"

输入bash或重新打开shell使以上环境变量生效,然后我们可以用个小例子测试是否运行正常。把以下内容写为h2co.inp:
geometry={
4
test
 C                  0.00000000    0.00000000   -0.56221066
 H                  0.00000000   -0.92444767   -1.10110537
 H                 -0.00000000    0.92444767   -1.10110537
 O                  0.00000000    0.00000000    0.69618930
}

basis=cc-pvtz
hf
ccsd(T)

然后在其所在目录下运行molpro h2co.inp,看看输出的h2co.out内容是否正常。



============= 串行版本的编译 =============

把并行编译的相应步骤替换为以下即可
./configure -gcc -gfortran
make -j
make quicktest



PS 1:molpro程序结果观看程序molproView的安装和使用见http://sobereva.com/70。
PS 2:程序手册、quickstart等文档的pdf文件在压缩包的doc目录下。

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