将prodrg得到的itp转化为rtp的程序itp2rtp V1.0
将prodrg得到的itp转化为rtp的程序itp2rtp V1.0
Itp2rtp V1.0: Converting the itp file produced by prodrg to rtp file
文/Sobereva @北京科音 写于2008年
通过prodrg获得的小分子.itp文件中，原子的顺序总是发生变化，无法直接include使用。如果分子数目较少可以手动修改，但对于磷脂层这样分子数众多的情况就十分麻烦。
笔者开发了itp2rtp程序以解决此问题。此程序对.itp的格式进行简单的转换，输入.itp文件，得到result.rtp，其中的内容可以拷进力场的.rtp中，在pdb2gmx中相应力场就 认识了此分子。pdb2gmx读进去的结构如果原子顺序和itp中不符，输出的结构就会按照rtp中的顺序进行排列，与itp相符，使用这样的结构就可以 直接在拓扑文件中include小分子.itp文件了。
使用方法：输入文件名即可，如c:\pop.itp
此处pop.itp为prodrg得到的.itp文件，不要修改格式。