GauMD2xyz：将Gaussian的从头算动力学轨迹转换为xyz轨迹的程序

GauMD2xyz：将Gaussian的从头算动力学轨迹转换为xyz轨迹的程序
GauMD2xyz: A program that converts Gaussian ab-initio dynamics trajectories to xyz trajectories

文/Sobereva@北京科音   2020-Apr-5

最新版本：1.2
下载地址：http://sobereva.com/soft/GauMD2xyz_1.2.zip
其中带.exe的是Windows版可执行文件，无后缀的是Linux版可执行文件。

简介：
此程序用来将Gaussian的BOMD或ADMP任务产生的轨迹转化为多帧.xyz格式（格式介绍见http://sobereva.com/477），以便被动力学可视化程序如VMD所进一步分析。

首先在Gaussian中执行BOMD或ADMP任务。之后启动本程序，输入fch/fchk文件名或者Gaussian输出文件名（必须以.out或.log为后缀），然后输入要产生的.xyz文件路径即可。文件包里有个test目录，里面包含了一些例子。

如果BOMD任务的ntraj设为了大于1，即计算多条轨迹，本程序还会提示用户选择要读入哪条轨迹。